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J-GLOBAL ID：201402286424183566   整理番号：14A1263368

次世代シーケンサーデータの解析手法 第1回 イントロダクション

Methods for analyzing next-generation sequencing data I. Introduction

著者 (5件)： 門田幸二 (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  SUN Jianqiang (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  TANG Min (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  西岡輔 (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  清水謙多郎 (東大 大学院農学生命科学研究科)
資料名： 日本乳酸菌学会誌  (Japanese Journal of Lactic Acid Bacteria)
巻： 25  号： 2  ページ： 87-94  発行年： 2014年07月05日 
JST資料番号： L3534A  ISSN： 1343-327X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 次世代シーケンサー(以下,NGS)は,モデル生物や非モデル生...

シソーラス用語： 自動分析計 ,...
準シソーラス用語： ゲノム解析 ,...

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分類 (1件)： 遺伝学研究法  (EC01020N)

引用文献 (37件)：

• Kawano, S., Ono, H., Takagi, T., Bono, H.: Tutorial videos of bioinformatics resources: online distribution trial in Japan named TogoTV, Brief Bioinform., 13,258-268 (2012).
• Field, D., Tiwari, B., Booth, T., Houten, S., Swan, D., Bertrand, N., Thurston, M.: Open software for biologists: from famine to feast. Nat. Biotechnol., 24,801-803 (2006).
• Simpson, J.T., Wong, K., Jackman, S.D., Schein, J.E., Jones, S.J., Birol, I.: ABySS: a parallel assembler for short read sequence data. Genome Res., 19,1117-1123 (2009).
• Zerbino, D.R. and Birney, E.: Velvet: algorithms for de novo short read assembly using de Bruijn graphs. Genome Res., 18,821-829 (2008).
• Langmead, B. and Salzberg, S.L.: Fast gapped-read alignment with Bowtie 2. Nat. Methods, 9, 357-359 (2012).

タイトルに関連する用語 (2件)： 次世代シーケンサー ,  解析手法