研究者
J-GLOBAL ID：201501077719678317   更新日: 2024年11月13日

落合 博

オチアイ ヒロシ | OCHIAI HIROSHI
所属機関・部署：
九州大学 生体防御医学研究所 附属高深度オミクスサイエンスセンター 遺伝子発現動態学分野

九州大学 生体防御医学研究所 附属高深度オミクスサイエンスセンター 遺伝子発現動態学分野 について


職名： 教授
ホームページURL (2件)： https://www.bioreg.kyushu-u.ac.jp/labo/ged/ ,  https://www.bioreg.kyushu-u.ac.jp/labo/ged/en/
研究分野 (4件)： ゲノム生物学 ,  化学物質影響 ,  放射線影響 ,  システムゲノム科学
研究キーワード (14件)： SNP ,  遺伝子ターゲティング ,  一塩基置換 ,  遺伝病 ,  遺伝子挿入 ,  TALEN ,  zinc-finger nuclease ,  ゲノム編集 ,  遺伝子発現ゆらぎ ,  ライブイメージング ,  CRISPR ,  ES細胞 ,  多能性幹細胞 ,  1細胞解析
競争的資金等の研究課題 (23件)：
  • 2024 - 2029 哺乳類初期発生における細胞可塑性を制御するエピコードの解読
  • 2023 - 2029 マルチモーダル時空間統合オミクス解析による哺乳類細胞運命制御基盤の理解
  • 2022 - 2025 高次ゲノム構造動態と遺伝子発現の連関解明
  • 2023 - 2025 転写動態制御を担うゲノムモダリティ要因の理解
  • 2022 - 2024 姉妹染色分体間の非ゲノム情報複製と転写動態の連関性解明
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論文 (38件)：
  • Hiroaki Ohishi, Hiroshi Ochiai. Image Analysis Protocol for DNA/RNA/Immunofluorescence (IF)-seqFISH Data. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2025. 2856. 419-432
  • Soundhararajan Gopi, Giovanni B Brandani, Cheng Tan, Jaewoon Jung, Chenyang Gu, Azuki Mizutani, Hiroshi Ochiai, Yuji Sugita, Shoji Takada. In siliconanoscope to study the interplay of genome organization and transcription regulation. 2024
  • Bitong Li, Yew Yan Wong, Neftali Flores-Rodriguez, Tara Davidson, Matthew S Graus, Valeriia Smialkovska, Hiroaki Ohishi, Angelika Feldmann, Hiroshi Ochiai, Mathias Francois. Anti-phase clustering of regulatory factors shapes gene bursting. bioRxiv. 2024
  • Ximena Garate, Pablo Aurelio Gómez-García, Manuel Fernández Merino, Marta Cadevall Angles, Chenggan Zhu, Alvaro Castells-García, Ilyas Ed-Daoui, Laura Martin, Hiroshi Ochiai, Maria Victoria Neguembor, et al. The relationship between nanoscale genome organization and gene expression in mouse embryonic stem cells during pluripotency transition. Nucleic acids research. 2024
  • Kosuke Tomimatsu, Takeru Fujii, Ryoma Bise, Kazufumi Hosoda, Yosuke Taniguchi, Hiroshi Ochiai, Hiroaki Ohishi, Kanta Ando, Ryoma Minami, Kaori Tanaka, et al. Precise immunofluorescence canceling for highly multiplexed imaging to capture specific cell states. Nature Communications. 2024
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MISC (28件)：
  • 落合 博, 大川 恭行. 創薬研究を加速する空間オミクス技術. 実験医学増刊 あなたのラボから薬を生み出す アカデミア創薬の実践 All JAPAN体制の先端技術支援を利用した創薬の最前線. 2024. 42. 2
  • Hiroshi Ochiai, Hiroaki Ohishi, Yuko Sato, Hiroshi Kimura. Organization of transcription and 3D genome as revealed by live-cell imaging. Current Opinion in Structural Biology. 2023. 81. 102615-102615
  • Hiroshi Ochiai. Facilitating genome function understanding using genome editing dependent bioimaging techniques. Gene and Genome Editing. 2023. 5. 100022
  • 大石裕晃, 落合 博. 特定RNA分子/DNA領域のライブイメージング技術. 生体の科学. 2023. 74. 3. 260-265
  • 落合 博. 揺らぎが奏でる生命機能. 月刊細胞. 2023. 55. 3
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特許 (3件)：
  • 複数蛍光色素定量方法および装置
  • 細胞の作製方法および該作製方法で作製された細胞
  • DNA結合ドメインを含むポリペプチド
書籍 (7件)：
  • 実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ エピゲノムをもっと見るためのクロマチン解析実践プロトコール (大川恭行,宮成悠介/編)
    羊土社 2020 ISBN:9784758122481
  • 実験医学別冊 完全版 ゲノム編集実験スタンダード CRISPR-Cas9の設計・作製と各生物種でのプロトコールを徹底解説 (山本 卓,佐久間哲史/編)
    羊土社 2019
  • 医療応用をめざすゲノム編集 最新動向から技術・倫理的課題まで 真下 知士/金田 安史編
    化学同人 2018
  • Genome Editing in Animals
    Springer New York 2017 ISBN:9781493971282
  • All Aboutゲノム編集 “革命的技術”はいかにして私たちの研究・医療・産業を変えるのか? 真下知士,山本 卓/編
    羊土社 2016 ISBN:9784758103596
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講演・口頭発表等 (66件)：
  • 3D genome architecture and its influence on gene regulation during transcriptional bursting
    (International Symposium: The 3D genome 2024)
  • Changes in higher-order genomic structures coupled with transcriptional states in mouse embryonic stem cells
    (The 33rd Hot Spring Harbor International Symposium 2024 2024)
  • 転写バーストにおけるヒストンアセチル化の動態変動
    (令和6年遺伝研究会 クロマチン・細胞核構造の動的変換とゲノム機能制御 2024)
  • The impact of transcription-coupled viscosity changes on enhancer-promoter interactions
    (第76回日本細胞生物学会大会 2024)
  • 空間オミクス技術で切り開く生命現象の高深度理解
    (2024医療・健康ユニットシンポジウム 2024)
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学歴 (3件)：
  • 2008 - 2011 広島大学 理学研究科 数理分子生命理学専攻
  • 2007 - 2008 広島大学 理学研究科 数理分子生命理学専攻
  • 2003 - 2007 広島大学 理学部 生物科学科
学位 (1件)：
  • 博士(理学) (広島大学)
経歴 (8件)：
  • 2023/03 - 現在 九州大学 生体防御医学研究所 附属高深度オミクスサイエンスセンター 遺伝子発現動態学分野 教授
  • 2021/04 - 2023/02 広島大学 大学院統合生命科学研究科 准教授
  • 2019/04 - 2021/03 広島大学 大学院統合生命科学研究科 講師
  • 2015/10/01 - 2019/03/31 科学技術振興機構 広島大学院理学研究科数理分子生命理学専攻 さきがけ研究者(専任)
  • 2013/04/01 - 2015/09/30 広島大学 大学院理学研究科 特任講師
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委員歴 (9件)：
  • 2024/08 - 2026/06 日本ゲノム編集学会 将来計画委員会 委員
  • 2022/01 - 2024/12 Journal of Biochemistry JB編集委員会 編集委員
  • 2021/08 - 2023/07 文部科学省 研究振興局 文部科学省 学術調査官(科学研究費補助金担当)
  • 2022/10 - 2023/06 日本ゲノム編集学会 第8回大会 大会準備委員
  • 2022/03 - 2022/04 日本ゲノム編集学会 日本ゲノム編集学会 選挙管理委員長
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受賞 (6件)：
  • 2023/06 - 日本エピジェネティクス研究会 日本エピジェネティクス研究会第16回年会 奨励賞 生細胞単一遺伝子イメージングによる転写動態のエピジェネティック制御機構の解明
  • 2021/10 - 広島大学 Distinguished Researcher
  • 2021/05/11 - 広島大学 広島大学大学院統合生命科学研究科 統合生命科学研究科奨励賞
  • 2016/11 - 平成28年度 広島大学長表彰
  • 2008/06 - 広島大学エクセレントスチューデント・スカラーシップ
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所属学会 (4件)：
日本生物物理学会 ,  日本ゲノム編集学会 ,  日本エピジェネティクス研究会 ,  日本分子生物学会
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