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J-GLOBAL ID：201502210494538443   整理番号：15A0596858

大規模なゲノムを有する種である植物のベニチョウジ(Cestrum elegans)(ナス科)における異常なテロメアモチーフ(TTTTTTAGGG)_nの特性評価

Characterisation of an unusual telomere motif (TTTTTTAGGG)_n in the plant Cestrum elegans (Solanaceae), a species with a large genome

著者 (10件)： PESKA Vratislav ,  FAJKUS Petr ,  FOJTOVA Miloslava ,  DVORACKOVA Martina ,  HAPALA Jan (Fac. of Sci., and CEITEC-Central European Inst. of Technol., Masaryk Univ., Kamenice 5, CZ-62500, Brno, CZE) ,  DVORACEK Vojtech (Inst. of Biophysics, Acad. of Sciences of the Czech Republic, v.v.i., Kralovopolska 135, CZ-61265, Brno, CZE) ,  POLANSKA Pavla (Fac. of Sci., and CEITEC-Central European Inst. of Technol., Masaryk Univ., Kamenice 5, CZ-62500, Brno, CZE) ,  LEITCH Andrew R. (School of Biological and Chemical Sciences, Queen Mary Univ. of London, London, E1 4NS, GBR) ,  SYKOROVA Eva ,  FAJKUS Jiri
資料名： Plant Journal  (Plant Journal)
巻： 82  号： 4  ページ： 644-654  発行年： 2015年05月 
JST資料番号： A1374A  ISSN： 0960-7412  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 異常なテロメア配列の特性評価は,テロメア発生,生物進化,維持及び機能のパターンに光を与える。近縁属であるキチョウジ,Vestia及びSessea属(ナス科ファミリー)由来の植物種は,既知の植物テロメア配列を欠いている。ここで,著者らはベニチョウジ(Cestrum elegans)のテロメアを特徴づけた。それは,その大規模なゲノムサイズと少ない染色体数(1C9.76pg;n=8)なので挑戦しやすい研究であった。著者らは,末端からのDNA及び染色体裂開を消化するBAL31消化酵素を併用する方法を開発した。そして,次世代配列解析(NGS)を用いてRepeatExplorerで分析されたデータを作出するために,それはde novo反復配列の同定と定量のために設計した。著者らは,ベニチョウジにおけるユニークな反復モチーフ(TTTTTTAGGG)_nを同定した。それは,半数体ゲノムにつき約30400コピー,テロメアにつき平均1900コピーで生じて,テロメラーゼで合成された。著者らは,テロメラーゼによってモチーフを合成することを示した。ベニチョウジの異常な真核生物(TTTTTTAGGG)_nテロメアモチーフの発生は,典型的な被子植物のテロメア(TTTAGGG)_n由来のモチーフのスイッチを表した。そのスイッチは,キチョウジ,SesseaとVestia属の分岐で生じた可能性があった。それが起こったときに,モチーフにおける変化はテロメア活性に及ぼす重大な影響をもたらした。したがって,どのようにテロメラーゼ及びテロメアが遺伝変化に反応するかについて研究するために,著者らの所見はユニークな機会を提供した。それは,テロメア機能により光を与える研究であった。Copyright 2015 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *テロメア ,  キャラクタリゼーション ,  テロメラーゼ ,  *ナス科 ,  生物進化 ,  反復配列 ,  染色体 ,  ヌクレオチド配列 ,  情報科学 ,  生物学 ,  遺伝子発現 ,  結合部位 ,  染色体異常 ,  長さ ,  被子植物 ,  真核生物
準シソーラス用語： テロメア短縮 ,  テロメア長 ,  *ベニチョウジ ,  次世代シークエンシング ,  生物情報科学 ,  蛋白質相互作用ドメインとモチーフ ,  特性評価

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： 大規模 ,  ゲノム ,  植物 ,  Cestrum ,  ナス科 ,  テロメア ,  モチーフ ,  特性評価