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J-GLOBAL ID：201502214526650999   整理番号：15A1022550

有毒化合物に対するヒト集団の反応の共同コンペティションによる予測

Prediction of human population responses to toxic compounds by a collaborative competition

著者 (40件)： EDUATI Federica (Wellcome Trust Genome Campus, Cambridge, GBR) ,  MENDEN Michael P (Wellcome Trust Genome Campus, Cambridge, GBR) ,  SAEZ-RODRIGUEZ Julio (Wellcome Trust Genome Campus, Cambridge, GBR) ,  MANGRAVITE Lara M (Sage Bionetworks, Washington, USA) ,  BARE J Christopher (Sage Bionetworks, Washington, USA) ,  NORMAN Thea (Sage Bionetworks, Washington, USA) ,  KELLEN Mike (Sage Bionetworks, Washington, USA) ,  FRIEND Stephen (Sage Bionetworks, Washington, USA) ,  WANG Tao (Univ. Texas Southwestern Medical Center, Texas, USA) ,  TANG Hao (Univ. Texas Southwestern Medical Center, Texas, USA) ,  YANG Jichen (Univ. Texas Southwestern Medical Center, Texas, USA) ,  ZHONG Rui (Univ. Texas Southwestern Medical Center, Texas, USA) ,  XIAO Guanghua (Univ. Texas Southwestern Medical Center, Texas, USA) ,  XIE Yang (Univ. Texas Southwestern Medical Center, Texas, USA) ,  HUANG Ruili (National Center for Advancing Translational Sci., Maryland, USA) ,  XIA Menghang (National Center for Advancing Translational Sci., Maryland, USA) ,  SIMEONOV Anton (National Center for Advancing Translational Sci., Maryland, USA) ,  ZHAN Xiaowei (Univ. Michigan, Michigan, USA) ,  ABDO Nour (Univ. North Carolina, North Carolina, USA) ,  KOSYK Oksana (Univ. North Carolina, North Carolina, USA) ,  RUSYN Ivan (Univ. North Carolina, North Carolina, USA) ,  ABDO Nour (Jordan Univ. Sci. and Technol., Irbid, JOR) ,  DEARRY Allen (National Inst. of Health, North Carolina, USA) ,  TICE Raymond R (National Inst. of Health, North Carolina, USA) ,  WRIGHT Fred A (North Carolina State Univ., North Carolina, USA) ,  STOLOVITZKY Gustavo (IBM, New York, USA) ,  ALAIMO Salvatore (Univ. Catania, Catania, ITA) ,  MONGIOVI Misael (Univ. Catania, Catania, ITA) ,  AMADOZ Alicia (Centro de Investigacion Principe Felipe (CIPF), Valencia, ESP) ,  DOPAZO Joaquin (Centro de Investigacion Principe Felipe (CIPF), Valencia, ESP) ,  HERNANSAIZ Rosa D (Centro de Investigacion Principe Felipe (CIPF), Valencia, ESP) ,  SEBASTIAN-LEON Patricia (Centro de Investigacion Principe Felipe (CIPF), Valencia, ESP) ,  AMMAD-UD-DIN Muhammad (Aalto Univ., Espoo, FIN) ,  AZENCOTT Chloe-Agathe (Max Planck Inst. for Developmental Biology and for Intelligent Systems, Tuebingen, DEU) ,  BORGWARDT Karsten (Max Planck Inst. for Developmental Biology and for Intelligent Systems, Tuebingen, DEU) ,  GRIMM Dominik (Max Planck Inst. for Developmental Biology and for Intelligent Systems, Tuebingen, DEU) ,  LOPEZ Felipe Llinares (Max Planck Inst. for Developmental Biology and for Intelligent Systems, Tuebingen, DEU) ,  SIMON-GABRIEL Carl Johann (Max Planck Inst. for Developmental Biology and for Intelligent Systems, Tuebingen, DEU) ,  BACARDIT Jaume (Newcastle Univ., Newcastle, GBR) ,  LAZZARINI Nicola (Newcastle Univ., Newcastle, GBR)
資料名： Nature Biotechnology  (Nature Biotechnology)
巻： 33  号： 9  ページ： 933-940  発行年： 2015年09月 
JST資料番号： H0870A  ISSN： 1087-0156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒトに対する有毒化合物の影響をコンピューターで予測することができれば,現在の化学物質安全性試験の不足が解消される可能性がある。本論文では,ヒト集団に健康上の悪影響を及ぼす可能性のある環境化合物の毒性予測を目的とする学界DREAMチャレンジの結果を紹介する。我々は,Tox21 1000ゲノムプロジェクトの一環として,遺伝子型および転写データが利用可能な884種類のリンパ芽球様細胞株で,156種類の化合物の細胞毒性を評価した。チャレンジの参加者は,ゲノムのプロファイルおよび化合物の構造特性に基づく集団レベルの細胞毒性データから,毒性反応の個人差を予測するアルゴリズムを開発した。提出された179通りの予測は,参加者には提供していない実験データセットで評価した。個々の細胞毒性予測は偶然を上回る弱い相関(ピアソンのr<0.28)を示し,複雑な形質のゲノムによる予測と一致した。対照的に,別の化合物に対する集団レベルの反応の予測は相関が高かった(r<0.66)。この結果は,リスク評価の精度は依然として最適に届かないものの,未知の化合物に伴う健康リスクを予測することができる可能性を示している。Copyright Nature Publishing Group 2015

シソーラス用語： ヒト ,  *毒物 ,  競争 ,  試験 ,  *細胞毒性 ,  リンパ球 ,  芽細胞 ,  培養細胞 ,  予測 ,  *リスク ,  遺伝学 ,  アルゴリズム ,  予測技法
準シソーラス用語： ゲノム解析 ,  *ヒトの健康リスク ,  リスク予測 ,  リンパ芽球細胞 ,  安全性試験

分類 (4件)： 予防医学一般  (GB01010B) ,  人間に対する影響  (EE05050C) ,  化学物質の毒性一般  (GZ02010C) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (5件)： ヒト ,  集団 ,  共同 ,  コンペティション ,  予測