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J-GLOBAL ID：201502246496613188   整理番号：15A0747078

天然変性蛋白質であるNoxaの,マイクロ秒の動態シミュレーションによる高解像度構造解析

High-resolution structural characterization of Noxa, an intrinsically disordered protein, by microsecond molecular dynamics simulations

著者 (2件)： ESPINOZA-FONSECA L. Michel (Dep. of Biochemistry, Molecular Biology and Biophysics Univ. of Minnesota, Minneapolis, MN 55455, USA. [e-mail]) ,  KELEKAR Ameeta
資料名： Molecular BioSystems  (Molecular BioSystems)
巻： 11  号： 7  ページ： 1850-1856  発行年： 2015年07月16日 
JST資料番号： W2331A  ISSN： 1742-206X  CODEN： MBOIBW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 天然変性蛋白質(IDPs)の構造と動態を高解像度で解析することは,有意義な仕事として残されている。極めて少数の全長の変性蛋白質の構造しか調べられていないので,IDPsの構造と機能の詳細な理解は限られている。我々は,変性蛋白質の詳細な構造的特徴を解析するために,大型Bcl-2ファミリーのアポトーシス調節蛋白質の最も小型のメンバーであるNoxaのマイクロ秒分子動態(MD)シミュレーションを行った。折りたたまれていない状態から出発する2.5μs MDにより,中心部にアンチパラレルβシート構造,それに隣接する2つの変性領域がNおよびC末端にあることが分かった。このトポロジーは蛋白質の変性予測および存在する実験データと良く一致した。我々は,この構造がNoxaの細胞内での機能や調節に必須であることを示した。また,無作為のMDシミュレーションと近年の力場の組み合わせにより,天然変性蛋白質の構造と機能的特徴を原子レベルで解明できることを明らかにした。Copyright 2015 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST

シソーラス用語： 力の場 ,  タンパク質 ,  *計算機シミュレーション ,  *分子構造 ,  位相幾何学 ,  癌タンパク質 ,  β構造 ,  変性
準シソーラス用語： 力場 ,  *天然変性蛋白質 ,  動力学シミュレーション ,  蛋白質構造 ,  トポロジー ,  *分子動態シミュレーション ,  Bcl-2ファミリー ,  *Noxa蛋白質 ,  *βシート構造 ,  蛋白質変性

分類 (3件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： 天然変性蛋白質 ,  NOXA ,  マイクロ秒 ,  シミュレーション ,  高解像度 ,  構造解析