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J-GLOBAL ID：201502247971376737   整理番号：15A0230468

RNA-RNA相互作用の推論におけるアクセシビリティの有効性評価

Evaluating Effectiveness of Accessibility to Infer RNA-RNA Interactions

著者 (6件)： KATO Yuki (Nara Inst. of Sci. and Technol. (NAIST), Nara, JPN) ,  MORI Tomoya (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  SATO Kengo (Keio Univ., Kanagawa, JPN) ,  MAEGAWA Shingo (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  HOSOKAWA Hiroshi (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  AKUTSU Tatsuya (Kyoto Univ., Kyoto, JPN)
資料名： 情報処理学会研究報告(Web)  (IPSJ Technical Report (Web))
巻： 2013  号： BIO-35  ページ： VOL.2013-BIO-35,NO.3 (WEB ONLY)  発行年： 2013年09月12日 
JST資料番号： U0451A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 短報  発行国： 日本 (JPN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA-RNA相互作用は遺伝子発現の転写後調節に関わるもので...

シソーラス用語： 転写【遺伝】 ,...
準シソーラス用語： 遺伝的調節

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分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (17件)：

• Rehmsmeier, M., Steffen, P., Höchsmann, M. and Giegerich, R.: Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes. RNA. vol. 10, pp. 1507-1517 (2004).
• Tafer. H. and Hofacker, I.L.: RNAplex: a fast tool for RNA-RNA interaction search. Bioinformatics, vol. 24, pp. 2657-2663 (2008).
• Wenzel, A., Akbasli, E. and Gorodkin. J.: RIsearch: fast RNA-RNA interaction search using a simplified nearest-neighbor energy model, Bioinformatics, vol. 28, pp. 2738-2746 (2012).
• Pervouchine, D.D: IRIS: intermolecular RNA interaction search, Genome Inform., vol. 15, pp. 92-101 (2004).
• Alkan, C., Karakoc, E., Nadeau, J.H., Sahinalp, S.C. and Zhang, K.: RNA-RNA interaction prediction and antisense RNA target search, J. Comput. Biol., vol. 13, pp. 267-282 (2006).

タイトルに関連する用語 (4件)： RNA-RNA相互作用 ,  推論 ,  アクセシビリティ ,  有効性評価