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J-GLOBAL ID：201502248450233928   整理番号：15A0733759

QCLO法によるグルコースオキシダーゼ活性中心の電子状態計算

Electronic state calculation of the active center of Glucose Oxidase by QCLO method

著者 (3件)： 吉田洵也 (東京大学大学院 工学系研究科) ,  平野敏行 (東京大学生産技術研究所 機械・生体系部門) ,  佐藤文俊 (東京大学生産技術研究所 革新的シミュレーション研究センター)
資料名： 生産研究  (Journal of Institute of Industrial Science, the University of Tokyo)
巻： 67  号： 3  ページ： 265-272 (J-STAGE)  発行年： 2015年 
JST資料番号： G0185A  ISSN： 0037-105X  CODEN： SEKEAI  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： タンパク質のような巨大分子のカノニカル分子軌道(CMO)計算においては,初期値の精度が解を得るための重要な要素となる.擬カノニカル局在化軌道(QCLO)法は巨大分子の高精度な初期値作成方法の1つである.これまでのQCLO法プログラムはペプチド鎖を前提とするため,ヘテロ分子に対しては適用が困難であった.そこで,任意の化学構造を取り扱う新たなQCLOプログラムを開発し,ヘテロ分子に対してもQCLO法を適用可能にした.本研究ではヘテロ分子FADを活性中心として持つタンパク質グルコースオキシダーゼ(GOX)モデルに対して,新たなQCLO法プログラムを用い,初期値の精度を解析した.また,CMO計算により得られたGOXの活性中心の電子状態について解析した.(著者抄録)

シソーラス用語： *分子軌道計算 ,  精度 ,  電子状態 ,  *グルコースオキシダーゼ ,  分子軌道 ,  LUMO ,  数値 ,  補因子 ,  *活性部位 ,  密度行列 ,  汎関数 ,  アルコール ,  窒素複素環化合物 ,  アデニンヌクレオチド ,  ウレア化合物 ,  芳香族縮合化合物 ,  ジヌクレオチド ,  *活性中心 ,  初期値 ,  ビタミンB群
準シソーラス用語： *QCLO法 ,  カノニカル分子軌道計算 ,  局在化軌道

分類 (1件)： 分子の幾何学的構造一般  (BH05021S)

物質索引 (1件)： FAD

引用文献 (8件)：

• 1) T. Inaba, S. Tahara, N. Nishikawa, H. Kashiwagi, F. Sato, “All-Electron Density Functional Calculation on Inslin with Quasi-Canonical Localized Orbitals”, Journal of Computational Chemistry., Vol.26, p987-993 (2004)
• 2) F. Sato, T. Yoshihiro, M. Era, H, Kashiwagi, “Calculation of all-electron wavefunction of hemoprotein cytochrome c by density functional theory”, Chemical Physics, Vol.341, p645-651 (2001)
• 3) J. Harris, “Simplified method for calculating the energy of weakly interacting fragments”, Physical Review B, Vol.31, No.4, p1770 (1984)
• 4) H. Kashiwagi, H. Iwai, K. Tokieda, M. Era, T.Yoshihiro and F. Sato, “Convergence process with quasi-canonical localized orbital in all-electron SCF calculation on proteins”, Molecular Physics, 101:1-2, p81-86, (2009)
• 5) Nishino-Uemura, T. Hirano and F. Sato, “Study of the quasicanonical localized orbital method based on protein structures”, Journal of Chemical Physics. Vol.127 p184106 (2007)

タイトルに関連する用語 (3件)： グルコースオキシダーゼ ,  活性中心 ,  電子状態計算