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J-GLOBAL ID：201502263544911147   整理番号：15A0741894

部位選択的に標識され,モザイク状構成を持つRNAの合成と応用

Synthesis and applications of RNAs with position-selective labelling and mosaic composition

著者 (14件)： LIU Yu (National Inst. of Health, Maryland, USA) ,  WANG Jinbu (National Inst. of Health, Maryland, USA) ,  STAGNO Jason R. (National Inst. of Health, Maryland, USA) ,  WANG Yun-Xing (National Inst. of Health, Maryland, USA) ,  HOLMSTROM Erik (Univ. Colorado, Colorado, USA) ,  NESBITT David J. (Univ. Colorado, Colorado, USA) ,  ZHANG Jinwei (National Heart, Lung and Blood Inst., Maryland, USA) ,  FERRE-D’AMARE Adrian R. (National Heart, Lung and Blood Inst., Maryland, USA) ,  YU Ping (Leidos Biomedical Res., Inc., Maryland, USA) ,  DYBA Marzena A. (Leidos Biomedical Res., Inc., Maryland, USA) ,  CHEN De (Leidos Biomedical Res., Inc., Maryland, USA) ,  LOCKETT Stephen (Leidos Biomedical Res., Inc., Maryland, USA) ,  YING Jinfa (National Inst. of Health, Maryland, USA) ,  SOUSA Rui (Univ. Texas Health Sci. Center, Texas, USA)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 522  号： 7556  ページ： 368-372  発行年： 2015年06月18日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA分子の構造と動態に関する知見は,RNAが持つ多くの生物学的機能を理解するために非常に重要である。また,合成RNAは治療薬や分子センサーとして応用されている。RNAの研究および技術応用は,修飾,あるいは標識されたヌクレオチドの,RNA内の特定の位置や領域への組み込みを可能にする方法によって劇的に向上するだろう。しかし,既存の方法では,このようなRNAを数十ミリグラムスケールで合成することは不可能であった。本研究では,部位選択的標識を持つRNAを合成するために,固相-液相ハイブリッド転写法と,自動化したロボットプラットフォームを開発した。我々は,アデニンリボスイッチの71ヌクレオチドのアプタマードメインのさまざまな同位体標識[核磁気共鳴(NMR)分光法用]または蛍光標識(蛍光共鳴エネルギー移動用)バージョンの作製に成功し,この手法が有用であることを示した。これらのRNA分子には,特定のループやリンカー,ヘリックス,複数の分離した部位,あるいは単一の内部部位が選択的に同位体標識されたものや,キッシングループ(kissing loop)の内部や近傍が蛍光標識されたRNA分子が含まれる。選択的に標識されたこうしたRNAの折りたたみは,従来法によって転写されたものと同じであるが,NMRスペクトルの解釈は非常に容易になっている。単一部位を同位体および蛍光で標識したRNAサンプルによって,アデニンリボスイッチの複数のコンホメーション状態が明らかになった。最後に,この技術を自動化するロボットプラットフォームと,その操作法について述べる。我々の選択的標識法は,RNAの構造と動態の研究に有用であり,また,細胞生物学研究や物質検出,疾患の診断などのさまざまな用途に用いるRNAセンサーの作製にも有用であろう。Copyright Nature Publishing Group 2015

シソーラス用語： *RNA合成 ,  mRNA ,  ヌクレオチド ,  立体配座 ,  NMR【磁気共鳴】 ,  蛍光共鳴エネルギー移動 ,  *RNA【核酸】 ,  折畳み構造 ,  ヌクレオチド配列
準シソーラス用語： FRET【移動】 ,  RNAアプタマー ,  リボスイッチ

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  遺伝子操作  (EC02050B)

タイトルに関連する用語 (4件)： 標識 ,  モザイク ,  RNA ,  応用