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J-GLOBAL ID：201502267466268084   整理番号：15A0026308

Dunaliella salinaのCDPK遺伝子のクローニングと生物情報学的解析【Powered by NICT】

Cloning and Bioinformatic Analysis of CDPK Gene of Dunaliella salina

著者 (5件)： Zhang Xiaolin (Dalian Ocean University/Key Lab. of Marine Bio-resources Restoration and Habitat Reparation in Liaoning Province; ...) ,  Chai Xiaojie (Dalian Ocean University/Key Lab. of Marine Bio-resources Restoration and Habitat Reparation in Liaoning Province; ...) ,  Zhang Ting (Dalian Ocean University/Key Lab. of Marine Bio-resources Restoration and Habitat Reparation in Liaoning Province; ...) ,  Yu Zhujun (Dalian Ocean University/Key Lab. of Marine Bio-resources Restoration and Habitat Reparation in Liaoning Province; ...) ,  Xue Fei (Dalian Ocean University/Key Lab. of Marine Bio-resources Restoration and Habitat Reparation in Liaoning Province; ...)
資料名： Henong Xuebao  (Henong Xuebao)
巻： 27  号： 4  ページ： 418-424  発行年： 2013年 
JST資料番号： C2036A  ISSN： 1000-8551  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： Dunaliella salina CDPK遺伝子(GenBank受入番号:JQ964113)をRT-PCRとRACE法によってクローン化し,さらにバイオインフォマティクスアプローチを用いて分析した。結果はCDPKのcDNAの完全長は3から052bp,1 332bpの70bpの5′-UTR,1 650bpの完全なオープンリーディングフレームをコードする549アミノ酸,及び3′-UTRを含んでいたことを示した。対応する蛋白質は,安定な親水性と弱酸性であり,二次構造の主成分としてランダムコイルとαヘリックスであり,3Dモデルを構築することに成功した。膜貫通領域及びシグナルペプチドなしで葉緑体と核に位置する蛋白質であった。蛋白質の配列は四セリンりん酸化部位,四トレオニンリン酸化部位と三チロシンりん酸化部位を含んでいた。または第五十三331日にアミノ酸で座位蛋白質キナーゼ領域,59第82日にアミノ酸からspaning蛋白質キナーゼのATP結合領域,第百七十三の185日へのアミノ酸のセリン/トレオニン蛋白質キナーゼ活性部位からなる,357第385日に分布した四EFハンド領域,第三百九十三421日,429年457日に465日四百九十三にアミノ酸であった。さらに系統発生解析により,この蛋白質はVolvox carteri.nagariensis,Chlamydomonas reinhardtiiとDunaliella tertiolectaのCDPKと最も最も近い遺伝的関係を持つことを示した。研究はCDPK機能とDunaliella salinaの耐塩性機構のシグナル伝達経路をさらに研究する根拠を用意した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  cDNA ,  タンパク質 ,  二次構造 ,  シグナルペプチド ,  葉緑体 ,  リン酸化 ,  タンパク質キナーゼ ,  結合部位 ,  セリン/トレオニンキナーゼ ,  活性部位 ,  系統発生 ,  *遺伝
準シソーラス用語： *バイオインフォマティクス ,  RACE法 ,  非翻訳領域 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (5件)： Dunaliella ,  遺伝子 ,  クローニング ,  生物情報学 ,  解析