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J-GLOBAL ID：201502268847168422   整理番号：15A0588315

OpenMebius:同位体非定常13C-利用代謝フラックス解析用のオープンソースソフトウェア

OpenMebius: An Open Source Software for Isotopically Nonstationary ¹³C-Based Metabolic Flux Analysis

著者 (5件)： KAJIHATA Shuichi (Osaka Univ., Osaka, JPN) ,  FURUSAWA Chikara (Osaka Univ., Osaka, JPN) ,  FURUSAWA Chikara (RIKEN, Osaka, JPN) ,  MATSUDA Fumio (Osaka Univ., Osaka, JPN) ,  SHIMIZU Hiroshi (Osaka Univ., Osaka, JPN)
資料名： BioMed Research International (Web)  (BioMed Research International (Web))
巻： 2014  号： Computational Biology  ページ： 627014 (WEB ONLY)  発行年： 2014年 
JST資料番号： U7008A  ISSN： 2314-6133  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 13C利用代謝フラックス解析((13)C-MFA)による代謝フラックスのin vivo測定は細胞生理学に価値ある情報を与える。従来,(13)C-MFAは同位体一定条件下で行われてきたが,最近,光合成活性を持つ細胞と準定常代謝状態における細胞のMFA用同位体非定常(INST)(13)C-MFAが開発された。今回,Windows上で働き,ユーザ決定構成ワークシートから等方性ラベリング富化を模擬する代謝モデルを自動生成するINST-(13)C-MFA用オープンソースソフトウェア,OpenMebiusを開発した。模擬実験を行い,このソフトウェアは精密なMFAを実現する可能性を実証した。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： 炭素同位体 ,  状態 ,  光合成 ,  *フラックス【流束】 ,  非平衡状態 ,  解析モデル ,  *ソフトウェア ,  炭素13 ,  プログラムパッケージ ,  微分方程式 ,  パラメータ推定 ,  数値解析 ,  ソフトウェア開発 ,  細胞生理 ,  *代謝
準シソーラス用語： MATLAB ,  *オープンソースソフトウェア ,  準定常状態 ,  *代謝フラックス ,  *代謝フラックス解析 ,  非定常状態

分類 (2件)： 代謝一般  (EB02030C) ,  システムプログラミング一般  (JD03010Y)

タイトルに関連する用語 (4件)： 同位体 ,  非定常 ,  代謝フラックス解析 ,  オープンソースソフトウェア