- 2022 - 2026 海底下の「静かな」微生物進化
- 2020 - 2023 腸管出血性大腸菌の出現機構の全容解明ー制御法開発のための基盤構築
- 2020 - 2023 多個体ハプロタイプ解析による超高ヘテロ接合性生物圏の実態解明
- 2018 - 2021 ハプロタイプ配列群に基づくアレル特異的ゲノム動態解析手法の開発
- 2016 - 2021 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
- 2017 - 2020 大規模比較ゲノム解析による腸管出血性大腸菌出現プロセスの解明
- 2016 - 2019 ハプロタイプを区別する新規ゲノムアセンブラの開発および超多様化ゲノム領域の解析
- 2015 - 2017 多倍体生物の全ゲノム配列構築手法の開発
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