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J-GLOBAL ID：201602202823840623   整理番号：16A0045208

HIVプロテアーゼの極度の薬物耐性突然変異体の配座転移

Conformational variation of an extreme drug resistant mutant of HIV protease

著者 (7件)： SHEN Chen-Hsiang (Dep. of Biology, Georgia State Univ., Atlanta, GA 30303, USA) ,  CHANG Yu-Chung (Dep. of Biology, Georgia State Univ., Atlanta, GA 30303, USA) ,  AGNISWAMY Johnson (Dep. of Biology, Georgia State Univ., Atlanta, GA 30303, USA) ,  HARRISON Robert W. (Dep. of Biology, Georgia State Univ., Atlanta, GA 30303, USA) ,  HARRISON Robert W. (Dep. of Computer Sci., Georgia State Univ., Atlanta, GA 30303, USA) ,  WEBER Irene T. (Dep. of Biology, Georgia State Univ., Atlanta, GA 30303, USA) ,  WEBER Irene T. (Dep. of Chemistry, Georgia State Univ., Atlanta, GA 30303, USA)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 62  ページ： 87-96  発行年： 2015年11月 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 20の変異(PR20)を有するHIV-1プロテアーゼの臨床的突然変異種に対して高水準の薬物耐性に結び付く分子機構を解析した。それらは,試験した薬物に対して数桁悪い親和性を有している。触媒的アスパラギン酸塩(PR20_D25N)のD25N突然変異を有する配位子フリーの二つの結晶構造は,異なるフラップ立体配座を有する三種類の二量体を示した。PR20_D25Nの多様な配座は,ユニークな「隠れた」コンホメーションの一つのフラップを有する二量体を含んでおり,それは活性部位を指向している。配位子フリーのPR20および野生型酵素の分子動力学(MD)シミュレーション解析は,PR20変異が二量体中の二つの単量体間の相関相互作用を変動させることを示した。二つのフラップは,野生型酵素に比べてPR20で独立に変動する傾向がる。X線結晶学およびMDシミュレーションによる構造解析の結果を組み合わせた。異常なフラップ立体配座および弱い相関的サブユニット間の動きは,PR20の高水準の耐性に寄与することができる。Copyright 2016 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： アスパラギン酸プロテイナーゼ ,  ウイルスタンパク質 ,  HIV【ウイルス】 ,  *薬物耐性 ,  *突然変異体 ,  *配座転移 ,  親和性 ,  配位子 ,  結晶構造 ,  フラップ ,  二量体 ,  活性部位 ,  野生型 ,  分子動力学 ,  X線回折 ,  構造解析 ,  計算機シミュレーション
準シソーラス用語： *HIVプロテアーゼ ,  分子動力学シミュレーション

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (4件)： HIVプロテアーゼ ,  薬物耐性 ,  突然変異体 ,  配座転移