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J-GLOBAL ID：201702203465455910   整理番号：17A0979764

細菌およびアーキアの単一増幅ゲノムに関する最小情報(MISAG)およびメタゲノムから組み立てられたゲノムに関する最小情報(MIMAG)

Minimum information about a single amplified genome (MISAG) and a metagenome-assembled genome (MIMAG) of bacteria and archaea

著者 (59件)： BOWERS Robert M (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  KYRPIDES Nikos C (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  HARMON-SMITH Miranda (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  DOUD Devin (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  REDDY T B K (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  SCHULZ Frederik (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  JARETT Jessica (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  RIVERS Adam R (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  ELOE-FADROSH Emiley A (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  TRINGE Susannah G (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  IVANOVA Natalia N (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  COPELAND Alex (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  CLUM Alicia (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  MALMSTROM Rex R (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  JUNGBLUTH Sean P (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  WOYKE Tanja (Dep. of Energy Joint Genome Inst., California, USA) ,  STEPANAUSKAS Ramunas (Bigelow Lab. for Ocean Sci., Maine, USA) ,  BECRAFT Eric D (Bigelow Lab. for Ocean Sci., Maine, USA) ,  RIVERS Adam R (Agricultural Res. Serv., United States Dep. of Agriculture, Florida, USA) ,  TRINGE Susannah G (Univ. California Merced, California, USA) ,  WOYKE Tanja (Univ. California Merced, California, USA) ,  BIRREN Bruce (Broad Inst., Massachusetts, USA) ,  PODAR Mircea (Oak Ridge National Lab., Tennessee, USA) ,  BORK Peer (European Molecular Biology Lab., Heidelberg, DEU) ,  WEINSTOCK George M (Jackson Lab. for Genomic Medicine, Connecticut, USA) ,  GARRITY George M (Michigan State Univ., Michigan, USA) ,  DODSWORTH Jeremy A (California State Univ., California, USA) ,  YOOSEPH Shibu (J. Craig Venter Inst., California, USA) ,  SUTTON Granger (J. Craig Venter Inst., California, USA) ,  GLOECKNER Frank O (Max Planck Inst. for Marine Microbiology, Bremen, DEU) ,  YILMAZ Pelin (Max Planck Inst. for Marine Microbiology, Bremen, DEU) ,  GILBERT Jack A (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  MEYER Folker (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  GILBERT Jack A (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  NELSON William C (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  HALLAM Steven J (Univ. British Columbia, British Columbia, CAN) ,  JUNGBLUTH Sean P (Univ. Southern California, California, USA) ,  ETTEMA Thijs J G (Uppsala Univ., Uppsala, SWE) ,  TIGHE Scott (Univ. Vermont Cancer Center, Vermont, USA) ,  KONSTANTINIDIS Konstantinos T (Georgia Inst. of Technol., Georgia, USA) ,  LIU Wen-Tso (Univ. Illinois at Urbana-Champaign, Illinois, USA) ,  BAKER Brett J (Univ. Texas-Austin, Texas, USA) ,  RATTEI Thomas (Univ. Vienna, Vienna, AUT) ,  EISEN Jonathan A (Univ. California, Davis, California, USA) ,  HEDLUND Brian (Univ. Nevada Las Vegas, Nevada, USA) ,  MCMAHON Katherine D (Univ. Wisconsin-Madison, Wisconsin, USA) ,  FIERER Noah (Univ. Colorado, Colorado, USA) ,  KNIGHT Rob (Univ. California San Diego, California, USA) ,  FINN Rob (European Molecular Biology Lab., Cambridge, GBR) ,  COCHRANE Guy (European Molecular Biology Lab., Cambridge, GBR) ,  KARSCH-MIZRACHI Ilene (National Inst. of Health, Maryland, USA) ,  TYSON Gene W (Univ. Queensland, Queensland, AUS) ,  RINKE Christian (Univ. Queensland, Queensland, AUS) ,  HUGENHOLTZ Philip (Univ. Queensland, Queensland, AUS) ,  PARKS Donovan H (Univ. Queensland, Queensland, AUS) ,  LAPIDUS Alla (St. Petersburg State Univ., St. Petersburg, RUS) ,  EREN A M (Knapp Center for Biomedical Discovery, Illinois, USA) ,  SCHRIML Lynn (National Cancer Inst., Maryland, USA) ,  BANFIELD Jillian F (Univ. California, Berkeley, California, USA)
資料名： Nature Biotechnology  (Nature Biotechnology)
巻： 35  号： 8  ページ： 725-731  発行年： 2017年08月 
JST資料番号： H0870A  ISSN： 1087-0156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本論文では,ゲノム標準コンソーシアム(Genomic Standards Consortium;GSC)が細菌およびアーキアのゲノム塩基配列を示すために開発した2種類の標準を紹介する。いずれもMIxS(Minimum Information about Any(x)Sequence;任意の配列に関する最小情報)を拡張したもので,単一増幅ゲノムに関する最小情報(MISAG)およびメタゲノムから組み立てられたゲノムに関する最小情報(MIMAG)といい,アセンブリの質ならびにゲノムの完全性および汚染の評価などが含まれる。この2つの標準は,MIGS(Minimum Information about a Genome Sequence;ゲノム配列に関する最小情報),MIMS(Minimum Information about a Metagenomic Sequence;メタゲノム配列に関する最小情報),およびMIMARKS(Minimum Information about a Marker Gene Sequence;マーカー遺伝子配列に関する最小情報)など,他のGSCチェックリストと組み合わせて使用することができる。学界規模でのMISAGおよびMIMAGの採用は,細菌およびアーキアの多様性に関するさらに強力な比較ゲノム解析を促進すると考えられる。Copyright Nature Japan KK 2017

シソーラス用語： *細菌 ,  *古細菌 ,  ヌクレオチド配列 ,  *ゲノム ,  遺伝子 ,  遺伝学 ,  生物多様性
準シソーラス用語： マーカー遺伝子 ,  メタゲノム ,  遺伝子配列 ,  遺伝的多様性 ,  比較ゲノミクス

分類 (2件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (5件)： 細菌 ,  アーキア ,  増幅 ,  ゲノム ,  メタゲノム