文献

J-GLOBAL ID：201702214316909451   整理番号：17A1437165

配列データによって明らかにされた江蘇省における遺伝的変異と5中国固有のブタ個体群の遺伝的構造【Powered by NICT】

Genetic variation and genetic structure of five Chinese indigenous pig populations in Jiangsu Province revealed by sequencing data

著者 (13件)： Xiao Q. (Department of Animal Science, School of Agriculture and Biology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, 200240, China) ,  Zhang Z. (Department of Animal Science, School of Agriculture and Biology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, 200240, China) ,  Sun H. (Department of Animal Science, School of Agriculture and Biology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, 200240, China) ,  Yang H. (National Station of Animal Husbandry, Beijing, 100125, China) ,  Xue M. (National Station of Animal Husbandry, Beijing, 100125, China) ,  Liu X. (Jiangshu Station of Animal Husbandry, Nanjing, 210036, China) ,  Zhang W. (Jiangshu Station of Animal Husbandry, Nanjing, 210036, China) ,  Zhen Y. (National Station of Animal Husbandry, Beijing, 100125, China) ,  Zhu M. (Jiangshu Station of Animal Husbandry, Nanjing, 210036, China) ,  Wang Q. (Department of Animal Science, School of Agriculture and Biology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, 200240, China) ,  Wang Q. (Shanghai Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Shanghai, 200240, China) ,  Pan Y. (Department of Animal Science, School of Agriculture and Biology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, 200240, China) ,  Pan Y. (Shanghai Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Shanghai, 200240, China)
資料名： Animal Genetics  (Animal Genetics)
巻： 48  号： 5  ページ： 596-599  発行年： 2017年 
JST資料番号： T0281A  ISSN： 0268-9146  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,ゲノム還元と配列決定(GGRS)法による遺伝子型決定を用いた五ブタ集団(北太湖地域,江蘇省)のゲノムと遺伝子構造の遺伝的変異,SNPsおよびインデル(挿入又は欠失,長さ50bp以下)を含む,を検討した。全五億八千百万良好なのは平均深さ11×の読み取りと2.16%の平均被覆率はと呼ぶ変異体に使用した。一般的に,202106のSNPと34415インデルが得られ,そのうちの2690SNPと224インデルした蛋白質をコードする変化を誘導することができた。これら変異体を含む遺伝子は機能的アノテーションを抽出した。遺伝子濃縮分析の結果は,研究下でのSNPは,生殖,耐病性,肉質および脂肪組織形質と関連している可能性があることを明らかにしたが,挿入欠失は脂肪組織及び疾患と主に関連していた。遺伝的構造の解析は,各個体群は他と同等であり,大きな分化を示し,それらの独自性を示唆することを示した。結論として,本研究の結果は,五種の中国原産ブタ集団の遺伝的変異と個体群構造の最初のゲノム概要を提供した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *中華人民共和国 ,  アノテーション ,  *個体群 ,  耐病性 ,  遺伝子 ,  ゲノム ,  脂肪組織 ,  一塩基多型
準シソーラス用語： 個体群構造 ,  肉質 ,  遺伝子構造 ,  遺伝子タイピング ,  *遺伝的構造 ,  *遺伝的変異 ,  *江蘇省 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： ゲノム配列決定 ,  GGRS ,  インデル ,  SNP

分類 (1件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (7件)： 江蘇省 ,  遺伝的変異 ,  中国 ,  固有 ,  ブタ ,  個体群 ,  遺伝的構造