文献

J-GLOBAL ID：201702222550951453   整理番号：17A0451110

遷移状態座標から誘導された薬理作用団モデルに基づく新しいPAD4阻害剤の同定【Powered by NICT】

Identification of novel PAD4 inhibitors based on a pharmacophore model derived from transition state coordinates

著者 (7件)： Wei Yu (State Key Laboratory of Medicinal Chemical Biology, College of Pharmacy and Tianjin Key Laboratory of Molecular Drug Research, Nankai University, Haihe Education Park, 38 Tongyan Road, Tianjin 300353, China) ,  Liu Ruihua (College of Life Sciences, Nankai University, Tianjin 300071, China) ,  Liu Cui (Biodesign Center, Tianjin Institute of Industrial Biotechnology, Chinese Academy of Sciences, Tianjin 300308, China) ,  Jin Jin (State Key Laboratory of Medicinal Chemical Biology, College of Pharmacy and Tianjin Key Laboratory of Molecular Drug Research, Nankai University, Haihe Education Park, 38 Tongyan Road, Tianjin 300353, China) ,  Li Dongmei (State Key Laboratory of Medicinal Chemical Biology, College of Pharmacy and Tianjin Key Laboratory of Molecular Drug Research, Nankai University, Haihe Education Park, 38 Tongyan Road, Tianjin 300353, China) ,  Lin Jianping (State Key Laboratory of Medicinal Chemical Biology, College of Pharmacy and Tianjin Key Laboratory of Molecular Drug Research, Nankai University, Haihe Education Park, 38 Tongyan Road, Tianjin 300353, China) ,  Lin Jianping (Biodesign Center, Tianjin Institute of Industrial Biotechnology, Chinese Academy of Sciences, Tianjin 300308, China)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 72  ページ： 88-95  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 1.4蛋白質アルギニンデイミナーゼ4(PAD4)は関節リウマチ(RA)の新規で選択的な阻害剤の開発のための魅力的な標的である。FアミジンはPAD4を標的とする機構に基づく阻害剤として知られており,活性部位Cys645を共有結合によって不活性化剤として使用した。PAD4の新しい構造阻害剤を同定するために,著者らは,著者らの以前のQM/MM計算からのFアミジンにより阻害されPAD4の遷移状態幾何構造に基づいて蛋白質の柔軟性を検討した。また薬理作用団モデルはFアミジンにより阻害されPAD4の遷移状態幾何学に基づく分子動力学(MD)シミュレーションからの五種の代表的な構造を用いた四特徴(ADHH)を含む生成した。薬理作用団モデルと分子ドッキング法を用いた仮想スクリーニングを行った,表面プラズモン共鳴(SPR)実験によりPAD4に対する,112μMと218μΜのK_D(解離平衡定数)値をもつ二つの分子の発見をもたらした。これらの二分子はPAD4阻害剤として役立つ可能性がある。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 分子動力学 ,  タンパク質 ,  活性部位 ,  *遷移状態 ,  解離平衡 ,  柔軟性 ,  共有結合
準シソーラス用語： 表面プラズモン共鳴法 ,  バーチャルスクリーニング ,  分子ドッキング ,  幾何構造 ,  活性化剤 ,  アルギニンデイミナーゼ ,  *阻害剤 ,  *薬理作用団モデル , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 蛋白質アルギニンデイミナーゼ ,  遷移状態 ,  分子動力学 ,  薬理作用団 ,  仮想スクリーニング

分類 (1件)： 酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W)

タイトルに関連する用語 (7件)： 遷移状態 ,  座標 ,  誘導 ,  薬理作用団モデル ,  PAD4 ,  阻害剤 ,  同定