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J-GLOBAL ID：201702225942160287   整理番号：17A1165370

RcdA,バイオフィルム形成のマスター調節因子を制御する転写因子の構造スケッチ【Powered by NICT】

A structural sketch of RcdA, a transcription factor controlling the master regulator of biofilm formation

著者 (8件)： Sugino Hirotaka (Department of Materials Science and Biotechnology, Graduate School of Science and Engineering, Ehime University, Matsuyama, Japan) ,  Usui Takanori (Department of Materials Science and Biotechnology, Graduate School of Science and Engineering, Ehime University, Matsuyama, Japan) ,  Shimada Tomohiro (School of Agriculture, Meiji University, Tama-ku, Kawasaki-shi, Kanagawa, Japan) ,  Nakano Masahiro (Department of Virus Research, Institute for Frontier Life and Medical Science, Kyoto University, Japan) ,  Ogasawara Hiroshi (Research Center for Supports to Advanced Science, Division of Gene Research, Shinshu University, Ueda, Nagano, Japan) ,  Ogasawara Hiroshi (Research Center for Fungal and Microbial Dynamism, Shinshu University, Nagano, Japan) ,  Ishihama Akira (Micro-Nano Technology Research Center and Department of Frontier Bioscience, Hosei University, Koganei, Tokyo, Japan) ,  Hirata Akira (Department of Materials Science and Biotechnology, Graduate School of Science and Engineering, Ehime University, Matsuyama, Japan)
資料名： FEBS Letters  (FEBS Letters)
巻： 591  号： 13  ページ： 2019-2031  発行年： 2017年 
JST資料番号： D0575A  ISSN： 0014-5793  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RcdAはcurlinサブユニット遺伝子D,Escherichia coliにおけるバイオフィルム形成のマスター調節因子の調節因子である。ここに,2.55Å分解能でのRcdAのX線構造を決定した。RcdAはヘリックス-ターン-ヘリックス(HTH)モチーフとC末端二量化ドメインを含むN末端DNA結合ドメイン(DBD)から構成され,結晶においてホモ二量体を形成する。RcdA DNA複合体の計算機結合モデルはDNA結合に関与する候補残基の予測を可能にした。構造誘導変異誘発,ゲルシフトアッセイ,原子間力顕微鏡観察およびレポーターアッセイと組み合わせて,HTHモチーフのα2におけるR32は標的DNAの認識及び結合において重要な役割を果たしているα3におけるT46はオリゴマ化のモードに影響することを示した。これらの結果は,RcdAのDNA結合モードに洞察を提供した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 複合体 ,  サブユニット ,  二量化 ,  変異誘発 ,  遺伝子 ,  オリゴマ化 ,  *転写因子 ,  DNA【核酸】
準シソーラス用語： ゲルシフトアッセイ ,  DNA結合 ,  ホモ二量体 ,  DNA結合ドメイン ,  C末端 ,  *調節因子 ,  *バイオフィルム形成 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 生物膜形成 ,  Escherichia coli ,  マスター転写調節因子 ,  TetRファミリー

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  生物学的機能  (EB03040U)

タイトルに関連する用語 (5件)： バイオフィルム形成 ,  マスター ,  調節因子 ,  転写因子 ,  スケッチ