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J-GLOBAL ID：201702226037290966   整理番号：17A0491784

概念的DFT記述子によるAc-Lys-(Ala)n-Lys-NH2ペプチドのプロトン化部位の計算機による予測

Computational Prediction of the Protonation Sites of Ac-Lys-(Ala)_n-Lys-NH2 Peptides through Conceptual DFT Descriptors

著者 (4件)： SASTRE Sebastian (Universitat de les Illes Balears, Palma de Mallorca, ESP) ,  FRAU Juan (Universitat de les Illes Balears, Palma de Mallorca, ESP) ,  GLOSSMAN-MITNIK Daniel (Universitat de les Illes Balears, Palma de Mallorca, ESP) ,  GLOSSMAN-MITNIK Daniel (Laboratorio Virtual NANOCOSMOS, Chih, MEX)
資料名： Molecules (Web)  (Molecules (Web))
巻： 22  号： 3  ページ： WEB ONLY  発行年： 2017年03月 
JST資料番号： U7014A  ISSN： 1420-3049  CODEN： MOLEFW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 一般式Ac-Lys-(Ala)n-Lys-NH2(0~5)の幾つかの分子構造と特性を計算するために,Def2TZVP基底セット,および,SMD溶媒和モデル(溶媒としての水)に関連する6つの密度汎関数(M11,M11L,MN12L,MN12SX,N12,およびN12SX)を評価した。概念的密度汎関数理論(DFT)によって,こうした系に関する化学反応記述子を計算した。求核攻撃と求電子性攻撃の活性部位を,福井関数指標,凝縮二重記述子Δf(r),および,求電子性Parr関数に,これらの活性部位を関連付けることで選択した。この結果によって,ペプチドのプロトン化部位の予測,および,2つのLys基のpKaの違いに関する定量的な説明が,可能となる。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *ペプチド ,  *密度汎関数法 ,  *溶媒和 ,  *モデル ,  *プロトン化 ,  *活性部位 ,  反応性
準シソーラス用語： 基底集合 ,  溶媒和モデル ,  求電子性 ,  求核性

分類 (1件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (8件)： DFT ,  記述子 ,  Ac ,  Lys ,  ペプチド ,  プロトン化 ,  計算機 ,  予測