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J-GLOBAL ID：201702226825747687   整理番号：17A0575081

2.5D Kinochemometricsによる蛋白質キナーゼ-リガンド相互作用の予測

Prediction of Protein Kinase-Ligand Interactions through 2.5D Kinochemometrics

著者 (4件)： BOSC Nicolas (Univ. Orleans, Orleans, FRA) ,  WROBLOWSKI Berthold (Janssen Pharmaceutica N.V., Beerse, BEL) ,  MEYER Christophe (Centre de Rech. Janssen-Cilag, Val de Reuil, FRA) ,  BONNET Pascal (Univ. Orleans, Orleans, FRA)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 57  号： 1  ページ： 93-101  発行年： 2017年01月 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒトのゲノムにコードされすでに同定された518の蛋白質キナーゼの一部は創薬の標的として注目されるが,活性部位のアミノ酸配列は共通してAsp-Phe-Gly(DFG)であり,この周辺の立体配座はこれらの蛋白質キナーゼで類似しているので,リガンド結合の特異性を持たせることが大きな課題となっている。本研究では,それぞれの蛋白質キナーゼのATP結合部位周辺の16残基を新たな三次元(3D)の記述子で示し,リガンドの二次元記述子とともに用いて,相互作用を検討するため,2.5D Kinochemometricsという計量法を開発した。この3D記述子で蛋白質キナーゼをうまく分類でき,DFG配列を有する活性ループのin型とout型の立体配座を区別でき,実験でのリガンドとの結合の有無をかなり再現できたが,実際には結合があっても結合なしと予想してしまう傾向があった。

シソーラス用語： *タンパク質キナーゼ ,  活性部位 ,  *酵素阻害剤 ,  *予測技法 ,  *分子間相互作用 ,  分子 ,  検証 ,  ケモメトリックス ,  解離定数 ,  感度 ,  度 ,  立体特異性 ,  立体構造 ,  *定量的構造活性相関 ,  ヒト ,  ゲノム
準シソーラス用語： 2.5D Kinochemometrics ,  *キナーゼ阻害剤 ,  リガンド ,  特異度

分類 (3件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W) ,  薬物の構造活性相関  (GV01050B)

タイトルに関連する用語 (4件)： 蛋白質キナーゼ ,  リガンド ,  相互作用 ,  予測