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J-GLOBAL ID：201702234152575879   整理番号：17A1624259

尿素誘導変性とMDシミュレーション研究からのヒト炭酸脱水酵素IXの熱力学的安定性の推定【Powered by NICT】

Estimation of thermodynamic stability of human carbonic anhydrase IX from urea-induced denaturation and MD simulation studies

著者 (7件)： Idrees Danish (Center for Interdisciplinary Research in Basic Sciences, Jamia Millia Islamia, Jamia Nagar, New Delhi - 110025, India) ,  Rahman Safikur (Department of Medical Biotechnology, Yeungnam University, Gyeongsan, 712-749, South Korea) ,  Shahbaaz Mohd. (Department of Chemistry, Durban University of Technology, Durban - 4000, South Africa) ,  Haque Md. Anzarul (Center for Interdisciplinary Research in Basic Sciences, Jamia Millia Islamia, Jamia Nagar, New Delhi - 110025, India) ,  Islam Asimul (Center for Interdisciplinary Research in Basic Sciences, Jamia Millia Islamia, Jamia Nagar, New Delhi - 110025, India) ,  Ahmad Faizan (Center for Interdisciplinary Research in Basic Sciences, Jamia Millia Islamia, Jamia Nagar, New Delhi - 110025, India) ,  Hassan Md. Imtaiyaz (Center for Interdisciplinary Research in Basic Sciences, Jamia Millia Islamia, Jamia Nagar, New Delhi - 110025, India)
資料名： International Journal of Biological Macromolecules  (International Journal of Biological Macromolecules)
巻： 105  号： P1  ページ： 183-189  発行年： 2017年 
JST資料番号： T0898A  ISSN： 0141-8130  CODEN： IJBMDR  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 炭酸アンヒドラーゼIX(CAIX)は膜貫通糖蛋白質,低酸素条件のもとで,癌細胞で過剰発現している。癌細胞では,CAIXは解糖代謝の高率の有害作用に対抗するために重要な役割を果たしている。腫瘍生存を支援するために,CAIXは細胞内pH中性または弱アルカリ性と細胞外酸性pHを維持する。CAIXの平衡変性及び立体配座安定性はストレス条件下でその構造的特徴を理解するために尿素濃度増加の存在下で測定した。二種類の分光法を尿素誘導変性を追跡するために使用し,尿素はCAIXの可逆的変性を誘導することを観察した。両方の光学的性質の規格化遷移曲線の一致はCAIXの変性は二状態過程,すなわち,天然状態⇔変性状態であることを示唆した。各変性曲線を熱力学パラメータ,ΔG_D~0,尿素誘導変性に関連したGibbs自由エネルギー変化(ΔG_D)の値,C_m(変性の中点)とm(=δΔG_D/δ[尿素])を推定するために解析した。さらに,異なる尿素濃度の存在下で蛋白質構造の動力学を調べるために50nsのCAIXの分子動力学シミュレーションを行った。in silicoおよびin vitro実験間の良好な一致を見た。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： in vitro実験 ,  腫瘍細胞 ,  分子動力学 ,  *熱力学的安定度 ,  酸素欠乏 ,  *ヒト ,  糖タンパク質 ,  *炭酸アンヒドラーゼ ,  *シミュレーション ,  構造特性 ,  Gibbs自由エネルギー ,  腫瘍 ,  ウレア化合物
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  蛋白質構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ヒト炭酸脱水酵素IX ,  尿素誘起変性 ,  蛋白質安定性 ,  蛋白質折畳み ,  分子動力学とシミュレーション

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (1件)： 尿素

タイトルに関連する用語 (9件)： 尿素 ,  誘導 ,  変性 ,  MDシミュレーション ,  研究 ,  ヒト ,  炭酸脱水酵素 ,  熱力学的安定性 ,  推定