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J-GLOBAL ID：201702237518507532   整理番号：17A1248433

亜鉛メタロプロテイナーゼとその阻害剤との間の特異的相互作用:ab initioフラグメント分子軌道計算【Powered by NICT】

Specific interactions between zinc metalloproteinase and its inhibitors: Ab initio fragment molecular orbital calculations

著者 (6件)： Ara Ayami (Department of Computer Science and Engineering, Toyohashi University of Technology, Toyohashi, 441-8580, Japan) ,  Kadoya Ryushi (Department of Computer Science and Engineering, Toyohashi University of Technology, Toyohashi, 441-8580, Japan) ,  Ishimura Hiromi (Department of Computer Science and Engineering, Toyohashi University of Technology, Toyohashi, 441-8580, Japan) ,  Shimamura Kanako (Department of Computer Science and Engineering, Toyohashi University of Technology, Toyohashi, 441-8580, Japan) ,  Sylte Ingebrigt (Department of Medical Biology, Faculty of Health Sciences, UiT The Arctic University of Norway, NO-9037 Tromso, Norway) ,  Kurita Noriyuki (Department of Computer Science and Engineering, Toyohashi University of Technology, Toyohashi, 441-8580, Japan)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 75  ページ： 277-286  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細菌は酵素シュードリジン(PLN)を分泌する細胞外蛋白質を分解すると,生成したペプチドを細菌の栄養素として用いた。PLNの阻害は細菌増殖を抑制することができることが期待される。このような阻害剤は細菌直接攻撃しないので,薬剤耐性産生細菌のリスクが少なかった。しかし,マトリックスメタロプロテイナーゼ(MMPs)のような内因性プロテイナーゼはPLNのそれに類似した活性部位を持つ,PLN阻害剤は,MMPの活性を阻害し,これらのプロテイナーゼによる基質分解の損失をもたらす可能性がある。,PLNのみの活性とMMPを阻害する薬剤が必要である。本研究では,二種の化合物(ARP101とLM2)を選択し,ab initio分子シミュレーションの使用によるPLNとMMPとそれらの特異的相互作用を調べた。結果に基づいて,著者らは強力なPLN阻害のための候補としてのいくつかの新しい化合物を提案し,PLNとの結合特性を調べ,化合物,トルエン群はLM2に導入し,元のLM2と比較してPLNのより大きな結合エネルギーを持つことを明らかにした。,この化合物は強力なPLN阻害剤であることが示唆された。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *相互作用 ,  *亜鉛 ,  薬物耐性 ,  活性部位 ,  ペプチド ,  *メタロプロテイナーゼ ,  結合エネルギー ,  マトリックスメタロプロテイナーゼ ,  細菌 ,  栄養素 ,  タンパク質 ,  *プロテイナーゼ ,  アルキルベンゼン
準シソーラス用語： 分子シミュレーション ,  *阻害剤 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： 亜鉛メタロプロテイナーゼ ,  M4ファミリー ,  細菌病原性因子 ,  マトリックスメタロプロテイナーゼ ,  酵素選択的阻害 ,  分子シミュレーション ,  蛋白質-リガンドドッキング ,  フラグメント分子軌道 ,  分子力学 ,  蛋白質-リガンド相互作用

分類 (3件)： 分子化合物  (CE02000C) ,  酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W) ,  薬物の構造活性相関  (GV01050B)

物質索引 (1件)： トルエン

タイトルに関連する用語 (6件)： 亜鉛 ,  メタロプロテイナーゼ ,  阻害剤 ,  相互作用 ,  フラグメント ,  分子軌道計算