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J-GLOBAL ID：201702240202513798   整理番号：17A0829574

次世代シーケンサーデータの解析手法 第10回 DDBJへの塩基配列の登録(実践編)

Methods for analyzing next-generation sequencing data X. Registration to DDBJ through Mass Submission System

著者 (12件)： 谷澤靖洋 (遺伝学研 生命情報研究セ) ,  藤澤貴智 (遺伝学研 生命情報研究セ) ,  真島淳 (遺伝学研 DDBJセ) ,  LEE Kyungbum (遺伝学研 DDBJセ) ,  遠野雅徳 (農業・食品産業技術総合研究機構) ,  坂本光央 (理研 バイオリソースセ) ,  坂本光央 (日本医療研究開発機構 PRIME) ,  大熊盛也 (理研 バイオリソースセ) ,  中村保一 (遺伝学研 生命情報研究セ) ,  中村保一 (遺伝学研 DDBJセ) ,  清水謙多郎 (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  門田幸二 (東大 大学院農学生命科学研究科)
資料名： 日本乳酸菌学会誌  (Japanese Journal of Lactic Acid Bacteria)
巻： 28  号： 2  ページ： 94-100  発行年： 2017年06月27日 
JST資料番号： L3534A  ISSN： 1343-327X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 多くの学術雑誌は,その論文中で決定された塩基配列を国際塩基配...

シソーラス用語： ヌクレオチド配列 ,...
準シソーラス用語： *DDBJ ,...

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分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (9件)：

• 1) Tanasupawat S, Shida O, Okada S, Komagata K. (2000) Lactobacillus acidipiscis sp. nov. and Weissella thailandensis sp. nov., isolated from fermented fish in Thailand. Int J Syst Evol Microbiol 50: 1479-1485.
• 2) Kajitani R, Toshimoto K, Noguchi H, Toyoda A, Ogura Y, et al. (2014) Efficient de novo assembly of highly heterozygous genomes from whole-genome shotgun short reads. Genome Res 24: 1384-1395.
• 3) Tanizawa Y, Fujisawa T, Kaminuma E, Nakamura Y., Arita M. (2016) DFAST and DAGA: Web-based integrated genome annotation tools and resources. Biosci Microbiota Food Health 35: 173-184.
• 4) Mashima J, Kodama Y, Fujisawa T, Katayama T, Okuda Y, et al. (2017) DNA Data Bank of Japan. Nucleic Acids Res 45: D25-D31.
• 5) Kodama Y, Shumway M, Leinonen R; International Nucleotide Sequence Database Collaboration. (2012) The Sequence Read Archive: explosive growth of sequencing data. Nucleic Acids Res 40: D54-56.

タイトルに関連する用語 (3件)： 次世代シーケンサー ,  解析手法 ,  塩基配列