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J-GLOBAL ID：201702244231510349   整理番号：17A1972412

日本におけるブタの糞便から検出されたサポウイルスの遺伝的多様性とintergenogroup組換事象【Powered by NICT】

Genetic diversity and intergenogroup recombination events of sapoviruses detected from feces of pigs in Japan

著者 (25件)： Kuroda Moegi (Kurayoshi Livestock Hygiene Service Center, Kurayoshi, Tottori 683-0017, Japan) ,  Masuda Tsuneyuki (Kurayoshi Livestock Hygiene Service Center, Kurayoshi, Tottori 683-0017, Japan) ,  Ito Mika (Ishikawa Nanbu Livestock Hygiene Service Center, Kanazawa, Ishikawa 920-3101, Japan) ,  Naoi Yuki (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Doan Yen Hai (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Musashimurayama, Tokyo 208-0011, Japan) ,  Haga Kei (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Musashimurayama, Tokyo 208-0011, Japan) ,  Haga Kei (Laboratory of Viral Infection I, Kitasato Institute for Life Sciences, Graduate School of Infection Control Sciences, Minato, Tokyo 108-8641, Japan) ,  Tsuchiaka Shinobu (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Kishimoto Mai (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Sano Kaori (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Omatsu Tsutomu (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Katayama Yukie (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Oba Mami (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Aoki Hiroshi (Faculty of Veterinary Science, Nippon Veterinary and Life Science University, Musashino, Tokyo 180-8602, Japan) ,  Ichimaru Toru (Department of Health and Medical Sciences, Ishikawa Prefectural Nursing University, Kahoku, Ishikawa 929-1210, Japan) ,  Sunaga Fujiko (Laboratory of Infectious Diseases, Azabu University, Sagamihara, Kanagawa 252-5201, Japan) ,  Mukono Itsuro (Ishikawa Nanbu Livestock Hygiene Service Center, Kanazawa, Ishikawa 920-3101, Japan) ,  Yamasato Hiroshi (Kurayoshi Livestock Hygiene Service Center, Kurayoshi, Tottori 683-0017, Japan) ,  Shirai Junsuke (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Katayama Kazuhiko (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Musashimurayama, Tokyo 208-0011, Japan) ,  Katayama Kazuhiko (Laboratory of Viral Infection I, Kitasato Institute for Life Sciences, Graduate School of Infection Control Sciences, Minato, Tokyo 108-8641, Japan) ,  Mizutani Tetsuya (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Oka Tomoichiro (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Musashimurayama, Tokyo 208-0011, Japan) ,  Nagai Makoto (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Nagai Makoto (Department of Bioproduction Science, Ishikawa Prefectural University, Nonoichi, Ishikawa 921-8836, Japan)
資料名： Infection, Genetics and Evolution  (Infection, Genetics and Evolution)
巻： 55  ページ： 209-217  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1228A  ISSN： 1567-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： サポウイルス(SaV)はヒトと動物に感染する腸内ウイルスである。SaVsは非常に多様であり,構造蛋白質(VP1)配列に基づく多重遺伝子群に分けた。日本のブタ集団におけるSaV遺伝子型分布についてはほとんど知られて八遺伝子型(GIII,GV,GVI,GVII,GVIII,GIX,GX,GXI)に属するブタから検出されたが,ほとんどSaVs。本研究では,SaVの二十六のほぼ完全なゲノム(>6000ヌクレオチド:nt)と三部分配列(2429nt,4364nt及び4419nt長さ,全VP1コード領域を含む)はメタゲノム法による日本全国を対象とする1下痢と15非下痢ブタ糞便から得られた。完全VP1アミノ酸配列(aa)の系統発生分析は,29のブタSaVsは七遺伝子型に分類されたことを明らかにした。GIII(11株),GV(1株),GVI(3株),GVII(6株),GVIII(1株),GX(3株),及びGXI(4株)。GXとGXIの最初のほぼ完全なゲノム配列を提示し,新規遺伝子群間単一遺伝子再組換事象を示した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  アミノ酸配列 ,  *日本 ,  多重遺伝子族 ,  下痢 ,  エンテロウイルス ,  ヒト ,  遺伝子型 ,  ゲノム ,  遺伝子クラスタ ,  ゲノム配列 ,  系統解析 ,  メタゲノム ,  VP1蛋白質 ,  *サポウイルス ,  微生物 ,  動物ウイルス

著者キーワード (5件)： 遺伝子群 ,  日本 ,  ブタ ,  再結合 ,  サポウイルス

分類 (1件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (7件)： 日本 ,  ブタ ,  糞便 ,  サポウイルス ,  遺伝的多様性 ,  組換 ,  事象