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J-GLOBAL ID：201702247681394514   整理番号：17A1561007

ヒトアポトーシスチトクロームcの血小板減少症Cargeeg変異体の構造動力学の研究:分子動力学シミュレーションアプローチ【Powered by NICT】

Investigation of structural dynamics of Thrombocytopenia Cargeeg mutants of human apoptotic cytochrome c: A molecular dynamics simulation approach

著者 (6件)： Muneeswaran Gurusamy (Department of Chemistry, School of Advanced Sciences, Kalasalingam Academy of Research and Education, Krishnankoil 626 126, Tamilnadu, India) ,  Kartheeswaran Subramanian (Department of Master of Computer Applications, School of Computing, Kalasalingam Academy of Research and Education, Krishnankoil 626 126, Tamilnadu, India) ,  Pandiaraj Manickam (Bio-MEMS and Microsystems Laboratory, Department of Electrical and Computer Engineering, Florida International University, USA) ,  Muthukumar Kaliappan (Applied Materials, Sunnyvale 94085, California, USA) ,  Sankaralingam Muniyandi (Department of Chemistry and Nano Science, Ewha Womans University, Seoul 03760, Republic of Korea) ,  Arunachalam Saravanavadivu (Department of Chemistry, School of Advanced Sciences, Kalasalingam Academy of Research and Education, Krishnankoil 626 126, Tamilnadu, India)
資料名： Biophysical Chemistry  (Biophysical Chemistry)
巻： 230  ページ： 117-126  発行年： 2017年 
JST資料番号： E0824A  ISSN： 0301-4622  CODEN： BICIAZ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： チトクロームc(cyt c)に対する自然発生変異は軽度常染色体優性血小板減少症(低レベル)患者,増強されたアポトーシス活性を有するcyt-c変異体を最近同定されている。しかし,この低血小板産生とアポトーシス増強の根底にある分子機構は不明のままである。は,明示的な水溶媒中の全原子分子動力学(MD)シミュレーションを用いたcyt-cアポトーシス(Fe~3+)の立体配座と動的変化に及ぼすヒスチジン(Y48H)によるセリン(G41S)とチロシン48によるグリシン41の変異の影響を調べるためにここに初めて行った。30ns分子動力学シミュレーションは野生型(WT)cyt-cに比べてG41SとY48Hにかなりの構造的差異を示し,ヘム活性部位での開放立体配座に重要な電子移動残基結果間の距離増加,β-ターンの大きな変動とα-ヘリックスである。さらに,βシートは全三cyt-cシミュレーションに残っているほとんど影響を受けないが,αヘリックスは両変異体シミュレーションにおけるβ-ターンへの立体配座スイッチを受ける。重要なこととして,ヘム活性部位周辺のαヘリックスβ-ターンへのこの立体配座スイッチは実験報告と一致NE2(His26)とO(Pro44)間の特に変異体シミュレーションにおける蛋白質内水素結合の損失に起因するべきである。更に,本動力学解析は,WT cyt-cの全体運動は主に第一固有ベクトルだけで関与していることを明らかにしたが,G41SとY48Hにおける全体運動はそれぞれ主に三と二固有ベクトル。全体として,詳細な原子論的レベルの情報は内因性アポトーシスの病理学における変異体cyt-cの構造不安定化の分子機構,血小板形成の調節不全と増強されたペルオキシダーゼ活性のための統一的記述を提供した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： β構造 ,  *変異 ,  水素結合 ,  活性部位 ,  立体配座 ,  *チトクロームc ,  *計算機シミュレーション ,  電子移動 ,  *アポトーシス ,  *血小板減少症 ,  *分子動力学 ,  野生型 ,  *血小板
準シソーラス用語： αヘリックス ,  分子機構 ,  *分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 血小板減少症 ,  アポトーシス ,  分子動力学 ,  水素結合 ,  立体配座スイッチ

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (8件)： ヒト ,  アポトーシス ,  チトクロームC ,  血小板減少症 ,  変異体 ,  構造動力学 ,  研究 ,  分子動力学シミュレーション