アレイSinorhizobium melilotiの大規模並列挿入部位配列決定は単相性ミニTn5トランスポゾン変異株ライブラリー【Powered by NICT】

Serrania Javier; Johner Tobias; Rupp Oliver; Goesmann Alexander; Becker Anke

文献

J-GLOBAL ID：201702247946437823 整理番号：17A1457283

アレイSinorhizobium melilotiの大規模並列挿入部位配列決定は単相性ミニTn5トランスポゾン変異株ライブラリー【Powered by NICT】

Massive parallel insertion site sequencing of an arrayed Sinorhizobium meliloti signature-tagged mini-Tn 5 transposon mutant library

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資料名：
巻： 257 ページ： 9-12 発行年： 2017年
JST資料番号： A0456C ISSN： 0168-1656 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

ゲノムトランスポゾン挿入部位の同定と結合したトランスポゾン変異誘発は,遺伝子機能研究のための強力なツールである。アレイサイン標識化トランスポゾン変異体ライブラリーの個別クローンに挿入部位を追跡することを可能にする階層的バーコード法を含むIllumina配列決定によるトランスポゾン挿入部位の並行定量のためのプロトコルを実装した。このプロトコルは共生窒素固定アルファプロテオバクテリアSinorhizobium meliloti(;Appl.Environ.Microbiol.72,4329 4337)の約12,000変異体から成る標識タグ付きミニTn5変異体ライブラリーを更に特性化に適用した。以前,挿入部位はこのライブラリーの5000変異体を決定した。次世代配列決定を用いた配列決定ライブラリー調製のためのアダプタ自由,逆PCR法を組み合わせて,4473種類の新規挿入部位を同定し,既知の挿入部位を持つトランスポゾン変異体の総数を9562に増加すること。トランスポゾンにより少なくとも1回衝突することを蛋白質コード遺伝子の数は総数3673破壊された遺伝子の,S.melilotiで予測された蛋白質コード遺伝子の59%に相当する1231増加した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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微生物の生化学 , 遺伝子の構造と化学

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