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J-GLOBAL ID：201702249619630883   整理番号：17A0991780

FIT 変動する野外条件下のトランスクリプトーム動態のための統計学的モデリングツール

FIT: statistical modeling tool for transcriptome dynamics under fluctuating field conditions

著者 (7件)： IWAYAMA Koji (Ryukoku Univ., Shiga, JPN) ,  AISAKA Yuri (LPixel Inc, Tokyo, JPN) ,  KUTSUNA Natsumaro (LPixel Inc, Tokyo, JPN) ,  KUTSUNA Natsumaro (Univ. Tokyo, Chiba, JPN) ,  NAGANO Atsushi J. (Ryukoku Univ., Shiga, JPN) ,  NAGANO Atsushi J. (Kyoto Univ., Shiga, JPN) ,  NAGANO Atsushi J. (JST-PRESTO, Saitama, JPN)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 11  ページ： 1672-1680  発行年： 2017年06月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 筆者らは先行研究において,トランスクリプトーム変動と環境条件の間の関連を記述するモデルを提唱し,そのモデルがイネにおけるトランスクリプトーム変動の予測が可能であることを立証した。本稿では,新しい統計モデルと先行研究に比べより効率が良いパラメーター最適化に基づくトランスクリプトーム予測のためのツールFITを紹介する。FITはhttps://cran.r-project.org/web/packages/FIT/にて利用可能である。

シソーラス用語： 遺伝学実験技術 ,  *解析 ,  統計模型 ,  *予測技法 ,  *環境
準シソーラス用語： *トランスクリプトーム解析 ,  *統計学的モデル ,  予測法 ,  *生態環境

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  生態学一般  (EE01010I)

タイトルに関連する用語 (6件)： FIT ,  野外 ,  トランスクリプトーム ,  統計学 ,  モデリング ,  ツール