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J-GLOBAL ID：201702255768904969   整理番号：17A1480235

逆転写酵素忠実度の次世代配列決定ベースの分析【Powered by NICT】

Next-generation sequencing-based analysis of reverse transcriptase fidelity

著者 (9件)： Yasukawa Kiyoshi (Division of Food Science and Biotechnology, Graduate School of Agriculture, Kyoto University, Kitashirakawa, Sakyo-ku, Kyoto 606-8502, Japan) ,  Iida Kei (Medical Research Support Center, Graduate School of Medicine, Kyoto University, Yoshida-Konoe-cho, Sakyo-ku, Kyoto 606-8501, Japan) ,  Okano Hiroyuki (Division of Food Science and Biotechnology, Graduate School of Agriculture, Kyoto University, Kitashirakawa, Sakyo-ku, Kyoto 606-8502, Japan) ,  Hidese Ryota (Department of Bioscience, School of Science and Technology, Kwansei-Gakuin University, 2-1 Gakuen, Sanda, Hyogo 669-1337, Japan) ,  Baba Misato (Division of Food Science and Biotechnology, Graduate School of Agriculture, Kyoto University, Kitashirakawa, Sakyo-ku, Kyoto 606-8502, Japan) ,  Yanagihara Itaru (Department of Developmental Medicine, Research Institute, Osaka Women’s and Children’s Hospital, Osaka 594-1101, Japan) ,  Kojima Kenji (Division of Food Science and Biotechnology, Graduate School of Agriculture, Kyoto University, Kitashirakawa, Sakyo-ku, Kyoto 606-8502, Japan) ,  Takita Teisuke (Division of Food Science and Biotechnology, Graduate School of Agriculture, Kyoto University, Kitashirakawa, Sakyo-ku, Kyoto 606-8502, Japan) ,  Fujiwara Shinsuke (Department of Bioscience, School of Science and Technology, Kwansei-Gakuin University, 2-1 Gakuen, Sanda, Hyogo 669-1337, Japan)
資料名： Biochemical and Biophysical Research Communications  (Biochemical and Biophysical Research Communications)
巻： 492  号： 2  ページ： 147-153  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0118A  ISSN： 0006-291X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,次世代シークエンシング(NGS)を用いた逆転写酵素(RT)の忠実度を解析するための簡単で迅速な方法を考案した。法は14件の無作為化塩基のタグと試験するRT,高忠実度DNAポリメラーゼを用いたPCR,NGS含有プライマーを用いた標準RNAからのcDNA合成反応を含んでいた。参照配列とそれぞれの配列を比較することにより,変異を同定した。変異は配列は同じ変異を含む同じタグを読むかどうかに基づくcDNA合成,PCR,またはNGSのいずれかによって導入された誤差に起因すると同定することができた。Moloneyマウス白血病ウイルス(MMLV)RT熱安定変異体MM4によるc DNA合成における誤り率またはRT活性を持つファミリーB DNAポリメラーゼの最近開発された16タプル変異体,RTX,Thermococcus kodakarensisから,0.75 1.0×10~ 4誤差/塩基であり,野生型ヒト免疫不全ウイルスとの反応における1型(HIV 1)RTは2.6×10~ 4誤差/塩基であることをした。全体として,著者らの方法は高価な光学と厄介なアダプターライゲーションを用いないハイスループット様式で異なる反応条件下で種々のRTの忠実度を正確に評価できた。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： DNAポリメラーゼ ,  変異 ,  B-DNA ,  *逆転写酵素 ,  野生型 ,  RNA【核酸】 ,  DNA【核酸】 ,  HIV【ウイルス】 ,  cDNA ,  誤り率
準シソーラス用語： 反応条件 ,  ハイスループット ,  Moloneyマウス白血病ウイルス ,  次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： cDNA ,  誤り率 ,  忠実度 ,  原子力発電所 ,  逆転写酵素

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： 転写酵素 ,  忠実度 ,  次世代 ,  分析