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J-GLOBAL ID:201702258774059707   整理番号:17A1457276

多遺伝子座配列タイピングと多重RAPD-PCRによる中国の伝統的サワードウから単離したLactobacillus sanfranciscensisの遺伝子型決定【Powered by NICT】

Genotyping of Lactobacillus sanfranciscensis isolates from Chinese traditional sourdoughs by multilocus sequence typing and multiplex RAPD-PCR
著者 (12件):
資料名:
巻: 258  ページ: 50-57  発行年: 2017年 
JST資料番号: A0434C  ISSN: 0168-1605  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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Lactobacillus sanfranciscensisは中国の伝統的サワードウにおける優勢な乳酸菌(LAB)種と中国蒸しパンのフレーバとレオロジー特性にconduces,1500年以上前に中国に由来する主食である。本研究の目的は,多遺伝子座配列タイピング(MLST)および多重ランダム増幅多型DNAポリメラーゼ連鎖反応(多重RAPD-PCR)による種々の領域における11中国の伝統的サワードウから98株のL.sanfranciscensis単離菌の種内多様性を記述することである。pgmAのフラグメントは,ただ一つの対立遺伝子を示したのでMLSTスキームは六遺伝子断片(gdh,gyrA,mapA,nox,pgmAとpta)から五(gdh,gyrA,mapA,noxとpta)であった。十の異なる配列型(STs)はMLSTにより明らかにし,それら分離株の79.8%を含む6は1つのクローン複合型に分類され,それらの間の密接な関係を示した。多重RAPD分析は,組合せプライマーOPL05+RD1を用いて行い,98株のL.sanfranciscensis単離菌に分けた70%の類似性レベルで6タイプに。結果によると,L.sanfranciscensis株MLSTにより示したの遺伝子型変異は地理的起源との関係を持たないと思われる。はより多くのグループを生成し,MLSTは多重RAPDと比較してより高い識別力を持つと思われるが,多重RAPDは,同じSTにおけるいくつかの株を識別するために役立つ可能性がある,L.sanfranciscensisの最適遺伝子型の特性化は,MLST及びマルチプレックスRAPD分析の組み合わせで得られた,異なる遺伝的変異を対象とした。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】
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