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J-GLOBAL ID：201702264397341037   整理番号：17A1208024

L418A変異Mycobacterium tuberculosisイソくえん酸リアーゼの活性損失につながるによる立体配座トポロジーと相互作用動力学の変化【Powered by NICT】

Alterations in conformational topology and interaction dynamics caused by L418A mutation leads to activity loss of Mycobacterium tuberculosis isocitrate lyase

著者 (4件)： Shukla Harish (Molecular and Structural Biophysics Laboratory, Department of Biochemistry, North-Eastern Hill University, Shillong 793022, India) ,  Shukla Rohit (Molecular and Structural Biophysics Laboratory, Department of Biochemistry, North-Eastern Hill University, Shillong 793022, India) ,  Sonkar Amit (Molecular and Structural Biophysics Laboratory, Department of Biochemistry, North-Eastern Hill University, Shillong 793022, India) ,  Tripathi Timir (Molecular and Structural Biophysics Laboratory, Department of Biochemistry, North-Eastern Hill University, Shillong 793022, India)
資料名： Biochemical and Biophysical Research Communications  (Biochemical and Biophysical Research Communications)
巻： 490  号： 2  ページ： 276-282  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0118A  ISSN： 0006-291X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Mycobacterium tuberculosis(結核菌)イソクエン酸リアーゼ(MtbICL)はコハク酸およびグリオキシル酸に対するイソクエン酸の開裂を触媒し,潜在的抗結核薬標的であることをグリオキシル酸サイクルの重要な酵素である。本研究の目的は,酵素活性の損失を引き起こすことをL418A点突然変異により誘導された構造変化を調べることである。技術,すなわち,分子動力学,主成分分析,時間依存二次構造,残基相互作用ネットワークおよび分子ドッキングを用いたL418A変異の影響を理解するための行った詳細な構造解析。L418A変異部位は,活性部位から離れた構造であるので,基質の結合に直接影響することはできない。著者らの結果は,酵素の集団運動,残留移動度,及び柔軟性は変異により増加することを示した。変異残基は,システムの全体的な配座動力学と共に残基-残基相互作用ネットワークを変化させ,酵素活性の消失をもたらした。ドッキング結果はL418A変異はMtbICLの活性部位にいくつかの残基と基質の結合相互作用に影響することを示唆した。MtbICLの構造動力学に関する情報を提供し,蛋白質の残基レベル相互作用の重要性を強調した。MtbICLを標的とする強力な阻害剤の設計に従事する科学界に重要な指針を提供するかもしれない。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *立体配座 ,  点突然変異 ,  *結核菌 ,  基質 ,  時間依存性 ,  ドッキング ,  二次構造 ,  *相互作用 ,  構造解析 ,  酵素活性度 ,  タンパク質 ,  活性部位 ,  主成分分析
準シソーラス用語： 分子ドッキング ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Mycobacterium tuberculosis ,  分子動力学シミュレーション ,  主成分分析 ,  蛋白質 ,  構造動力学 ,  残基相互作用ネットワーク

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (9件)： 変異 ,  Mycobacterium ,  イソくえん酸リアーゼ ,  活性 ,  損失 ,  立体配座 ,  トポロジー ,  相互作用 ,  動力学