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J-GLOBAL ID：201702268279659414   整理番号：17A0122816

微生物セルラーゼ遺伝子を解析するために適切である土壌微生物DNAを分離するための方法

A method for isolation of soil microbial DNA that is suitable for analysis of microbial cellulase genes

著者 (4件)： KOBAYASHI Yoshiki (Yamaguchi Univ., Yamaguchi, JPN) ,  HAYASHIDA Erika (Yamaguchi Univ., Yamaguchi, JPN) ,  YOKOYAMA Kazuhira (Yamaguchi Univ., Yamaguchi, JPN) ,  FUJII Katsuhiko (Yamaguchi Univ., Yamaguchi, JPN)
資料名： Separation Science and Technology  (Separation Science and Technology)
巻： 51  号： 6-9  ページ： 1053-1062  発行年： 2016年06月 
JST資料番号： D0435B  ISSN： 0149-6395  CODEN： SSTEDS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,ブナ林(Fagus crenata)土壌表面から0~10cm深さから採取した土壌-バイオマス(セルロース,おがくずまたはキチン粉末)-水からなる三成分混合物,いわゆる内因性セルロース分解微生物由来のDNAを抽出するための方法を開発した。この方法において,分画遠心沈殿によって土壌粒子から土壌有機物質(SOM)なしペレットとして微生物及び真菌細胞溶解を成功裡に採取して,そして細胞沈殿物からセチルトリメチルアンモニウムブロミドを用いて抽出した15~20kbpの平均サイズを有するrDNAがPCR-変性剤勾配ゲル電気泳動法(PCR-DGGE)によって種々の微生物と真菌細胞から回収されたことを示した。

シソーラス用語： *セルラーゼ ,  *遺伝子 ,  土壌微生物 ,  *抽出 ,  土壌有機物 ,  *DNA【核酸】 ,  分離 ,  陽イオン界面活性剤 ,  沈殿物 ,  遠心分離 ,  ゲル電気泳動 ,  濃度勾配 ,  添加剤 ,  塩基対 ,  広葉樹林 ,  落葉樹林 ,  ブナ ,  PCR法 ,  真菌類 ,  RNA【核酸】 ,  細胞生理 ,  脂肪族アミン ,  第四アンモニウム
準シソーラス用語： *DNA抽出 ,  DNA分離 ,  Fagus crenata ,  PCR-DGGE法 ,  セルロース分解 ,  ブナ林 ,  遠心沈殿 ,  細胞溶解 ,  真菌 ,  真菌RNA ,  土壌有機物質 ,  内因性 ,  *微生物遺伝子 ,  変性剤濃度勾配ゲル電気泳動

分類 (2件)： 生物物理的研究法  (EA03020V) ,  土壌生物  (FB04050N)

物質索引 (1件)： セチルトリメチルアンモニウムブロミド

タイトルに関連する用語 (6件)： 微生物 ,  セルラーゼ ,  遺伝子 ,  解析 ,  土壌微生物 ,  DNA