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J-GLOBAL ID：201702270162437246   整理番号：17A1510434

ネパール,2007における下痢の入院小児において検出されたブタ様ヒト再集合体G26P[19]ロタウイルスA株の全ゲノム特性解析【Powered by NICT】

Whole genome characterisation of a porcine-like human reassortant G26P[19] Rotavirus A strain detected in a child hospitalised for diarrhoea in Nepal, 2007

著者 (9件)： Agbemabiese Chantal Ama (Department of Molecular Epidemiology, Graduate School of Biomedical Sciences, Nagasaki University, Nagasaki, Japan) ,  Agbemabiese Chantal Ama (Leading Program, Graduate School of Biomedical Sciences, Nagasaki University, Nagasaki, Japan) ,  Nakagomi Toyoko (Department of Molecular Epidemiology, Graduate School of Biomedical Sciences, Nagasaki University, Nagasaki, Japan) ,  Gauchan Punita (Department of Molecular Epidemiology, Graduate School of Biomedical Sciences, Nagasaki University, Nagasaki, Japan) ,  Sherchand Jeevan Bahadur (Department of Medical Microbiology and Public Health Research Laboratory, Institute of Medicine, Tribhuvan University, Kathmandu, Nepal) ,  Pandey Basu Dev (Department of Health Services, Ministry of Health, Government of Nepal, Kathmandu, Nepal) ,  Cunliffe Nigel A. (Department of Clinical Infection, Microbiology & Immunology, Institute of Infection and Global Health, University of Liverpool, Liverpool, United Kingdom) ,  Nakagomi Osamu (Department of Molecular Epidemiology, Graduate School of Biomedical Sciences, Nagasaki University, Nagasaki, Japan) ,  Nakagomi Osamu (Leading Program, Graduate School of Biomedical Sciences, Nagasaki University, Nagasaki, Japan)
資料名： Infection, Genetics and Evolution  (Infection, Genetics and Evolution)
巻： 54  ページ： 164-169  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1228A  ISSN： 1567-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： カトマンズ,ネパールにおける急性下痢のために入院した小児における検出された稀なG26ロタウイルスA株RVA/Human wt/NPL/07N1760/2007/G26P[19]。07N1760の完全ゲノムはその進化史を調べると同様にベトナム歪RVA/Human wt/VNM/30378/2009/G26P[19],その完全な遺伝子型配置が知られているのみG26株との関係を調べるために測定した。07N1760の遺伝子型配置をG26P[19]-I12R1C1M1A8N1T1E1H1,VP6遺伝子を除いてベトナム30378のそれと同じ独特の配置。系統発生解析は,両株はそれらの類似した遺伝子型配置にもかかわらず系統レベルで無関係であったことを明らかにした。07N1760のI12VP6遺伝子はGenBankに六現在堆積したI12配列から高度に分岐した。NSP2遺伝子を除いて,07N1760の残りの遺伝子はブタおよびブタ様ヒトRVA遺伝子と系統を共有していた。NSP2遺伝子は典型的なブタおよびブタ様ヒト系統とは異なっていたヒトRVA N1系統に属していた。結論として,ネパールG26P[19]株07N1760はヒト宿主への伝播後のおそらく内遺伝子型再配列によるヒトWa様RVA株からNSP2遺伝子を由来するブタRVA株であった。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *子供 ,  遺伝子 ,  *ゲノム ,  *ヒト ,  系統発生 ,  *性能分析 ,  *ネパール連邦民主共和国 ,  ベトナム社会主義共和国 ,  *入院 ,  遺伝子型 ,  *ロタウイルス
準シソーラス用語： GenBank ,  進化史 ,  急性下痢 ,  カトマンズ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ロタウイルス ,  分子疫学 ,  再集合 ,  種間伝播 ,  ネパール急性下痢

分類 (3件)： 消化器の臨床医学一般  (GH01030P) ,  進化論一般  (EC03010Q) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (11件)： ネパール ,  下痢 ,  入院 ,  小児 ,  ブタ ,  ヒト ,  集合体 ,  ロタウイルス ,  株 ,  ゲノム ,  特性解析