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J-GLOBAL ID：201702270318474599   整理番号：17A1248446

CRF01_AE HIV-1プロテアーゼにおけるL10F,L10F/N88SとL90M変異の薬剤耐性機構:分子動力学シミュレーションと結合自由エネルギー計算【Powered by NICT】

Drug Resistance Mechanism of L10F, L10F/N88S and L90M mutations in CRF01_AE HIV-1 protease: Molecular dynamics simulations and binding free energy calculations

著者 (3件)： Vasavi C.S. (School of Biosciences and Technology, VIT University, Vellore 632014, Tamil Nadu, India) ,  Tamizhselvi Ramasamy (School of Biosciences and Technology, VIT University, Vellore 632014, Tamil Nadu, India) ,  Munusami Punnagai (Center for Computational Natural Sciences and Bioinformatics, International Institute of Information Technology, Hyderabad 500 032, India)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 75  ページ： 390-402  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： HIV-1プロテアーゼはウイルス複製と成熟,抗レトロウイルス治療のための最も魅力的な標的の一つとするにおいて重要な役割を果たす。開発途上国におけるHIV感染の大部分は非Bサブタイプによるものであった。サブタイプAEは急速に普及し,世界的巨大集団を感染した。サブタイプAEの活性部位の変異は阻害剤との相互作用を阻害した。非活性部位変異は阻害剤の結合に間接的に影響を与えるとその耐性機構はよく理解されていない。サブタイプAEプロテアーゼにおける戦闘薬剤耐性新しい有効な阻害剤を設計することが重要である。本研究では,分子動力学シミュレーションと結合自由エネルギー計算を用いてネルフィナビルによる非活性部位変異L10F,L10F/N88S及びL90Mの影響を調べた。シミュレーションはL10F,L10F/N88S変異体は,ネルフィナビルの結合親和性が,L90M変異体は結合親和性を増加させるを減少させることを示唆した。ネルフィナビルとAsp30の間の水素結合の形成は効率的な結合のために重要である。ネルフィナビルのベンズアミド部分はL10F,L10F/N88S錯体の大きな位置ずれを示し,L10F/N88S変異は三十番目の残基と八十八残基の側鎖原子の間の水素結合を変化させる。Asp30とネルフィナビルの間の水素結合相互作用が薬物抵抗性につながる破壊される。本研究では,AEサブタイプにおける実験的に観察された強く連鎖した突然変異L10F/N88Sの耐性機構を明らかにした。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 水素結合 ,  活性部位 ,  *HIV1 ,  *薬物耐性 ,  *計算機シミュレーション ,  *ペプチド結合ヒドロラーゼ ,  相互作用 ,  *変異 ,  突然変異
準シソーラス用語： 結合親和性 ,  阻害剤 ,  サブタイプ ,  *HIV-1プロテアーゼ ,  *結合自由エネルギー ,  *分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： HIV-1プロテアーゼ ,  ネルフィナビル ,  亜型 ,  非活性部位突然変異 ,  耐性機構

分類 (1件)： 酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W)

物質索引 (1件)： ネルフィナビル

タイトルに関連する用語 (6件)： HIV-1プロテアーゼ ,  変異 ,  薬剤耐性機構 ,  分子動力学シミュレーション ,  結合自由エネルギー ,  計算