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J-GLOBAL ID：201702271887233183   整理番号：17A1121003

Microbacteriumsp.からのIclR同族体の結晶構造ひずみHM58【Powered by NICT】

Crystal structure of an IclR homologue from Microbacterium sp. strain HM58-2

著者 (6件)： Akiyama Tomonori (Department of Bioscience, Tokyo University of Agriculture, Setagaya-ku, Tokyo156-8502, Japan) ,  Yamada Yusuke (Structural Biology Research Center, Photon Factory, Institute of Materials Structure Science, High Energy Accelerator Research Organization, 1-1 Oho, Tsukuba305-0801, Japan) ,  Takaya Naoki (Department of Environmental and Life Sciences, Tsukuba University, Tennodai, Tsukuba, Japan) ,  Ito Shinsaku (Department of Bioscience, Tokyo University of Agriculture, Setagaya-ku, Tokyo156-8502, Japan) ,  Sasaki Yasuyuki (Department of Bioscience, Tokyo University of Agriculture, Setagaya-ku, Tokyo156-8502, Japan) ,  Yajima Shunsuke (Department of Bioscience, Tokyo University of Agriculture, Setagaya-ku, Tokyo156-8502, Japan)
資料名： Acta Crystallographica Section F  (Acta Crystallographica Section F)
巻： 73  号： 1  ページ： 16-23  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2479A  ISSN： 2053-230X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細菌転写因子IclR(イソクエン酸リアーゼ制御因子)は一成分シグナル伝達系,基質結合ドメイン(SBD)に接続されたヘリックス-ターン-ヘリックス(HTH)型DNA結合ドメイン(DBD)の共通のモチーフを共有するメンバーである。ここでは,唯一の炭素源としてのアシルヒドラジドを代謝,Microbacteriumsp.株HM58からIclRホモログ(Mi IclR)の結晶構造を報告した。Mi IclRは初期段階としてアシルヒドラジド分解に関与するオペロンを調節するために期待されている。天然単波長異常回折(SAD)実験は,分子置換と組み合わせて行った。CCP4からCRANK2は非対称ユニットにおいて1000残基から成るホモ四量体の完全な構造を位相とモデル化に成功し,モデルは2.1Å分解能まで精密化した。Mi IclRの全体構造は他の既知のIclR構造として同じドメイン組み合わせを共有したが,DBDとSBD間の相対的幾何学は異なる。Mi IclR四量体の形状がユニークな各サブユニットにおける推定上の基質結合部位は四量体の外部からアクセス可能である,既知IclR構造におけるとして内部埋め込みとは対照的である。領域形状におけるこれらの違いは,IclRsの転写調節に寄与する可能性がある。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： オペロン ,  イソクエン酸リアーゼ ,  *結晶構造 ,  モデリング ,  サブユニット ,  HOMO ,  細菌 ,  ヒドラジド ,  分解能 ,  基質 ,  四量体 ,  転写因子 ,  非対称性 ,  結合部位 ,  *マイクロバクテリウム属 ,  微生物
準シソーラス用語： *Microbacterium , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： イソくえん酸リアーゼ調節因子 ,  転写因子 ,  Microbacterium ,  ヒドラジド ,  一成分系

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (3件)： 同族体 ,  結晶構造 ,  ひずみ