BphD,ビフェニル分解におけるメタ-分解産物ヒドロラーゼにより利用される水支援求核機構【Powered by NICT】

Dong Lihua; Dong Lihua; Zhang Shujun; Liu Yongjun

文献

J-GLOBAL ID：201702275886919584 整理番号：17A1464425

BphD,ビフェニル分解におけるメタ-分解産物ヒドロラーゼにより利用される水支援求核機構【Powered by NICT】

A water-assisted nucleophilic mechanism utilized by BphD, the meta-cleavage product hydrolase in biphenyl degradation

出版者サイト複写サービスで全文入手 {{ this.onShowCLink("http://jdream3.com/copy/?sid=JGLOBAL&noSystem=1&documentNoArray=17A1464425&COPY=1") }}
高度な検索・分析はJDreamⅢで {{ this.onShowJLink("http://jdream3.com/lp/jglobal/index.html?docNo=17A1464425&from=J-GLOBAL&jstjournalNo=B0044D") }}

著者 (4件)： , , ,
資料名：
巻： 76 ページ： 448-455 発行年： 2017年
JST資料番号： B0044D ISSN： 1093-3263 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

α/β-ヒドロラーゼスーパーファミリーのメンバーとして,メタ切断産物(MCP)ヒドロラーゼは一般的に細菌による芳香族化合物の好気的異化におけるC-C結合の開裂を加水分解するSer-His-Asp触媒三つ組を利用した。BphDは2 ヒドロキシペンタ 2,4 ジエン酸(HPD)および安息香酸に2-ヒドロキシ-6-オキソ-6-フェニルヘキサ 2,4 ジエン酸(H OPDA)の加水分解を触媒するMCPヒドロラーゼの一種である。本論文では,組合せ量子力学と分子力学(QM/MM)法はBurkholderia xenovorans LB400由来BphDの反応機構を研究するために使用した。最近解決された結晶構造に基づいて,三つの計算モデルを構築した。計算結果から,BphDは水支援求核機構,アシル化及び脱アシル化段階を含むを利用していることを明らかにした。アシル化反応では,活性部位水分子はSer112とHis265と水素結合を形成することによりSer112からのプロトン移動を支援するカルバニオン中間体(基質)し,このプロトン移動は,アシル化中間体を形成する基板のC6 カルボニルに脱プロトン化Ser112の求核攻撃と一致していた。脱アシル化において,Asp237His265ダイアドは加水分解水が求核攻撃がアシル酵素中間体の崩壊をもたらすを活性化するために一般塩基として作用する。アシル化と脱アシル化プロセスは21.0と23.9kcal/molの最も高いエネルギー障壁に相当した。触媒反応の間,活性部位水とAsp237His265ダイアドは各素過程に重要な役割を果たしている。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

, , , , , , , , , , , , ,
, 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： , , , ,

酵素一般 , 分子の電子構造

, , , , , ,

前のページに戻る