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J-GLOBAL ID：201702291374683619   整理番号：17A1448562

Varkudサテライトリボザイムにおける基質ヘリックス構造のリモデリングおよび開裂ループ活性化のための構造的基礎

Structural Basis for Substrate Helix Remodeling and Cleavage Loop Activation in the Varkud Satellite Ribozyme

著者 (3件)： DASGUPTA Saurja (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  SUSLOV Nikolai B. (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  PICCIRILLI Joseph A. (Univ. Chicago, Illinois, USA)
資料名： Journal of the American Chemical Society  (Journal of the American Chemical Society)
巻： 139  号： 28  ページ： 9591-9597  発行年： 2017年07月19日 
JST資料番号： C0254A  ISSN： 0002-7863  CODEN： JACSAT  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 部位特異的なRNA開裂や連結反応を触媒するVarkudサテライトリボザイムの基質認識には,基質とリボザイムの触媒作用領域との間のキッシンググループ相互作用が関与する。この相互作用により,基質の結合および活性化において極めて重要な”シフトされた”コンフォメーションへの,基質ヘリックスレジスタの再配置がもたらされる。本報は,リボザイムの3.3Åの結晶構造を記述しているが,この結晶構造は,リボザイムの触媒領域にドッキングされた基質のシフトされたコンフォメーションを明らかにしている。これまでにNMRにより導かれた分離された不活性な基質に対する構造と比較すると,開裂ループの触媒的活性化における3成分相互作用が窺われた。

シソーラス用語： リボザイム ,  基質 ,  *ヘリックス構造 ,  *活性化 ,  モデリング ,  性質 ,  *RNA【核酸】 ,  分子間相互作用 ,  *結晶構造 ,  立体配座 ,  活性部位 ,  RNAスプライシング
準シソーラス用語： *Varkudサテライトリボザイム ,  リモデリング ,  *触媒活性部位 ,  部位特異性

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  生物物理的研究法  (EA03020V)

タイトルに関連する用語 (9件)： サテライト ,  リボザイム ,  基質 ,  ヘリックス構造 ,  リモデリング ,  開裂 ,  ループ ,  活性化 ,  基礎