細菌DNA増幅用のPCR用プライマーセット、細菌種の検出及び/または同定用キット及び細菌種の検出及び/または同定方法

発明者： , , , , , ,
出願人/特許権者：
代理人 (2件)：宮崎昭夫 , 緒方雅昭
公報種別：再公表公報
出願番号（国際出願番号）：JP2014076864
公開番号（公開出願番号）：WO2015-053293
出願日： 2014年10月07日
公開日（公表日）： 2015年04月16日
要約：

本発明の目的は、PCR法による検体中での細菌種の検出または同定における感度の更なる向上のために有用なプライマーセット、これを用いたPCR用のセット及び検体中の細菌種の検出または同定方法を提供すること、並びに、細菌由来の核酸の混入量を最小限として、上記のプライマーセットを用いたPCR法を行うことによって、検体中での細菌種の検出または同定における感度の更なる向上を達成することにある。これらの目的を達成するめために、本発明にかかる細菌DNA増幅用のPCR用のプライマーセットは、特定のプライマーペアからなる第S1群〜第S7群の各群毎に1つのプライマーペアを選択して得られた7つのプライマーペアのうちの、少なくとも1つのプライマーペアを含む。更に、本発明にかかる細菌種検出用のキットは、特定のプライマーペアからなる第K1群〜第K7群の各群毎に1つのプライマーペアを選択して得られた7つのプライマーペアのうちの、少なくとも1つのプライマーペアを含む。

請求項（抜粋）：

下記第S1群〜第S7群の各群毎に1つのプライマーペアを選択して得られた7つのプライマーペアのうちの、少なくとも1つのプライマーペアを含むことを特徴とする細菌DNA増幅PCR用のプライマーセット。第S1群: 1-1A:配列番号1の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号22及び27のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 1-2A:配列番号10の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号20及び21のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 1-3A:配列番号11の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号16、18及び26のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 1-4:配列番号12の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号16〜27のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 1-5:配列番号13の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号16〜27のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 1-7:配列番号15の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号16〜27のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 1-8A:配列番号6の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号16、19〜21、23、24、26及び27のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 1-9A:配列番号7の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号16〜21、23、24、26及び27のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、または 1-10A:配列番号8の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号16〜21、23、24、26及び27のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、第S2群: 2-1A:配列番号28の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号45及び47〜50のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 2-2:配列番号29の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号44、45、47、48及び50のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 2-3:配列番号30の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号45及び47〜50のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 2-4:配列番号31の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号46及び47のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 2-5:配列番号32の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号45及び47〜49のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 2-6A:配列番号33の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号44、45及び47〜50のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 2-7A:配列番号34の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号45、47及び48のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 2-8A:配列番号35の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号44、45、48及び49のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 2-9A:配列番号36の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号44、45、48及び49のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 2-10A:配列番号37の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号45及び47〜50のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 2-11:配列番号38の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号44〜50のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 2-12A:配列番号39の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号44〜48及び50のいずれか1つのリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 2-13:配列番号40の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号44〜50のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 2-14A:配列番号41の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号45及び46のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 2-15A:配列番号42の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号48及び49のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、または 2-16A:配列番号43の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号44、46〜48及び50のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、第S3群: 配列番号51の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号52の配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア第S4群: 4-1:配列番号53の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号57〜61のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 4-2:配列番号54の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号59及び61のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 4-3:配列番号55の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号57〜59及び号61のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、または 4-4:配列番号56の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号57〜59及び61のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア第S5群 5-1A:配列番号62の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号70、73〜75のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 5-2:配列番号63の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号70〜75のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 5-3:配列番号64の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号70〜75のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 5-4:配列番号65の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号70〜75のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 5-5A:配列番号66の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号70、72、73及び75のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 5-6A:配列番号67の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号70、71及び73〜75のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 5-7:配列番号68の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号70〜75のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、または 5-8:配列番号69の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号70〜75のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア第S6群 6-1A:配列番号76の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号93、96及び101〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 6-2:配列番号77の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号91、96及び101〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 6-3:配列番号78の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号91及び101〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 6-4A:配列番号79の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号91及び101〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 6-5:配列番号80の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号91、93及び100〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 6-6:配列番号81の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号91、93及び101〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 6-7:配列番号82の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号91、96、97及び101〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 6-8:配列番号83の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号91、101〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 6-9:配列番号84の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号91及び101〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 6-10:配列番号85の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号91及び101〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 6-11A:配列番号86の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号91、93及び101〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 6-12:配列番号87の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号91、96及び101〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 6-13:配列番号88の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号91及び101〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 6-14:配列番号89の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号91及び101〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、または 6-15:配列番号90の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号91、92、96及び101〜103のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーのそれぞれの組み合わせからなるプライマーペア第S7群 7-1A:配列番号104の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号5及び118〜125、127、128、130及び131のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 7-2A:配列番号105の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号5及び118〜125のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 7-3A:配列番号106の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号2、5及び116及び118〜131のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 7-4A:配列番号107の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号120及び121のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 7-5A:配列番号108の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号120及び123のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 7-6A:配列番号109の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号2、118〜122、124及び126のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 7-7A:配列番号110の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号118、120、121、124及び126〜130のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 7-8A:配列番号111の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号2、5及び118〜131のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 7-9A:配列番号112の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号2、5及び116、及び118〜125のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 7-10A:配列番号113の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号2、5、118〜126、130及び131のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、 7-11A:配列番号114の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号5の配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア、または 7-12A:配列番号115の配列からなるフォワードプライマーと、配列番号2及び5のいずれか1つの配列からなるリバースプライマーの組み合わせからなるプライマーペア。

IPC (3件)：

C12N 15/09 , C12Q 1/68 , C12Q 1/04

FI (3件)：

C12N15/00 A , C12Q1/68 A , C12Q1/04

Fターム (15件)：

4B063QA01 , 4B063QA13 , 4B063QA18 , 4B063QQ06 , 4B063QQ42 , 4B063QQ52 , 4B063QR01 , 4B063QR32 , 4B063QR35 , 4B063QR55 , 4B063QR62 , 4B063QR75 , 4B063QS16 , 4B063QS25 , 4B063QX01

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