研究者
J-GLOBAL ID:201801001436329878   更新日: 2024年10月04日

永田 隆平

ナガタ リュウヘイ | Nagata Ryuhei
所属機関・部署:
職名: 助教
ホームページURL (1件): https://scholar.google.co.jp/citations?hl=ja&user=xLaTxv4AAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
研究分野 (2件): 分子生物学 ,  構造生物化学
研究キーワード (2件): 代謝酵素 ,  構造生物学
競争的資金等の研究課題 (4件):
  • 2022 - 2025 ピロリン酸依存性プロテインキナーゼの探索とその構造機能解析
  • 2019 - 2022 ポリケタイド合成酵素の基質受け渡し機構の解明を目指した高分解能構造解析
  • 2019 - 2022 医薬資源として有望なヒドロキサム酸を合成する酵素の機構解明と合理的改変法の確立
  • 2016 - 2018 酵素の工業利用のためにATP依存性のリン酸化酵素をピロリン酸依存性に改良する方法
論文 (6件):
  • Ryuhei Nagata, Makoto Nishiyama, Tomohisa Kuzuyama. Substrate Recognition Mechanism of a Trichostatin A-Forming Hydroxyamidotransferase. Biochemistry. 2023. 62. 12. 1833-1837
  • Ryuhei Nagata, Hironori Suemune, Masaya Kobayashi, Tetsuro Shinada, Kazuo Shin-ya, Makoto Nishiyama, Tomoya Hino, Yusuke Sato, Tomohisa Kuzuyama, Shingo Nagano. Structural Basis for the Prenylation Reaction of Carbazole-Containing Natural Products Catalyzed by Squalene Synthase-like Enzymes. Angewandte Chemie International Edition. 2022. 61. 20. e202117430
  • Yasunobu Mori, Hiroki Kawamura, Takaaki Sato, Takayuki Fujita, Ryuhei Nagata, Masahiro Fujihashi, Kunio Miki, Haruyuki Atomi. Identification and enzymatic analysis of an archaeal ATP-dependent serine kinase from the hyperthermophilic archaeon Staphylothermus marinus. Journal of Bacteriology. 2021. 203. 16. e00025-21
  • Ryuhei Nagata, Masahiro Fujihashi, Takaaki Sato, Haruyuki Atomi, Kunio Miki. Identification of a pyrophosphate-dependent kinase and its donor selectivity determinants. Nature Communications. 2018. 9. 1765
  • Ryuhei Nagata, Masahiro Fujihashi, Hiroki Kawamura, Takaaki Sato, Takayuki Fujita, Haruyuki Atomi, Kunio Miki. Structural Study on the Reaction Mechanism of a Free Serine Kinase Involved in Cysteine Biosynthesis. ACS Chemical Biology. 2017. 12. 6. 1514-1523
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MISC (6件):
  • 永田隆平, 葛山智久. スクアレン合成酵素に似た酵素による芳香族化合物のプレニル化反応の仕組み. 化学と生物. 2023. 61. 6. 260-262
  • 永田隆平, 葛山智久. 末端ヒドロキサム酸基を合成する酵素の基質認識機構の解明. Photon Factory Activity Report 2022. 2023
  • 永田隆平, 小林正弥, 西山真, 葛山智久. 【プレスリリース】2つの酵素の特徴をあわせ持つ酵素の反応機構の解明. 2022
  • 永田隆平, 藤橋雅宏. ATPでなくピロリン酸を利用する新規リン酸化酵素の基質認識機構. 化学と生物. 2018. 56. 12. 779-780
  • 永田隆平, 藤橋雅宏, 三木邦夫. 【プレスリリース】お財布にも環境にもやさしい化学反応を発見 -新規リン酸化酵素がATPでなくピロリン酸を利用する仕組み-. 2018
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講演・口頭発表等 (27件):
  • 末端ヒドロキサム酸基の生合成を担う酵素hydroxyamidotransferase の基質認識機構(口頭)
    (日本結晶学会令和5年度大会 2023)
  • Trichostatin A 生合成におけるヒドロキサム酸基の生合成機構の解明(口頭)
    (天然有機化合物討論会 2022)
  • ヒドロキサム酸基の生合成を担う酵素TsnB9の基質認識機構に関する研究(口頭)
    (日本農芸化学会2022年度大会 2022)
  • 真菌Eupenicillium ludwigii由来PKSチオエステラーゼElbBの基質認識機構に関する構造解析(口頭)
    (日本農芸化学会2022年度大会 2022)
  • 末端ヒドロキサム酸基を合成する放線菌由来酵素TsnB9の基質認識機構に関する構造生物学的研究(ポスター)
    (日本結晶学会令和3年度大会 2021)
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Works (15件):
  • 8HAR: SAH-bound C-Methyltransferase Fur6 from Streptomyces sp. KO-3988
    Noguchi, T, Nagata, R, Tomita, T, Kuzuyama, T 2023 -
  • Front Cover Art of Biochemistry | Vol. 62, No. 12
    Ryuhei Nagata 2023 -
  • 7YLZ: Unliganded form of hydroxyamidotransferase TsnB9
    Nagata, R, Nishiyama, M, Kuzuyama, T 2023 -
  • 7VWT: Carbazole Prenyl Transferase CqsB4
    Suemune, H, Nagata, R, Kuzuyama, T, Nagano, S 2022 -
  • 7VWS: Carbazole Prenyl Transferase LvqB4
    Suemune, H, Nagata, R, Kuzuyama, T, Nagano, S 2022 -
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学歴 (3件):
  • 2014 - 2018 京都大学 大学院理学研究科 化学専攻博士後期課程
  • 2012 - 2014 京都大学 大学院理学研究科 化学専攻修士課程
  • 2008 - 2012 京都大学 理学部 理学科
学位 (1件):
  • 博士(理学) (京都大学)
経歴 (6件):
  • 2024/10 - 現在 名古屋大学 大学院生命農学研究科 応用生命科学専攻 助教
  • 2022/04 - 2024/09 東京大学 大学院理学系研究科 生物科学専攻 特任助教
  • 2019/04 - 2022/03 東京大学 大学院農学生命科学研究科 応用生命工学専攻 日本学術振興会特別研究員(PD)
  • 2020/05 - 2020/09 お茶の水女子大学 理学部 非常勤講師
  • 2018/04 - 2019/03 東京大学 生物生産工学研究センター 特任研究員
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委員歴 (1件):
  • 2023/04 - 現在 PF News 編集委員会 外部編集委員
受賞 (1件):
  • 2015/09 - 日本生物高分子学会 優秀発表賞
所属学会 (5件):
日本バイオインフォマティクス学会 ,  日本農芸化学会 ,  日本蛋白質科学会 ,  日本結晶学会 ,  日本生化学会
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