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J-GLOBAL ID：201902253408209667   整理番号：19A0176707

システイン生合成に関与する遊離セリンキナーゼの反応機構に関する構造研究【JST・京大機械翻訳】

Structural Study on the Reaction Mechanism of a Free Serine Kinase Involved in Cysteine Biosynthesis

著者 (10件)： Nagata Ryuhei (Department of Chemistry, Graduate School of Science, Kyoto University, Japan) ,  Fujihashi Masahiro (Department of Chemistry, Graduate School of Science, Kyoto University, Japan) ,  Kawamura Hiroki (Department of Synthetic Chemistry and Biological Chemistry, Graduate School of Engineering, Kyoto University, Japan) ,  Sato Takaaki (Department of Synthetic Chemistry and Biological Chemistry, Graduate School of Engineering, Kyoto University, Japan) ,  Sato Takaaki (JST, CREST, Japan) ,  Fujita Takayuki (Department of Synthetic Chemistry and Biological Chemistry, Graduate School of Engineering, Kyoto University, Japan) ,  Atomi Haruyuki (Department of Synthetic Chemistry and Biological Chemistry, Graduate School of Engineering, Kyoto University, Japan) ,  Atomi Haruyuki (JST, CREST, Japan) ,  Miki Kunio (Department of Chemistry, Graduate School of Science, Kyoto University, Japan) ,  Miki Kunio (JST, CREST, Japan)
資料名： ACS Chemical Biology  (ACS Chemical Biology)
巻： 12  号： 6  ページ： 1514-1523  発行年： 2017年 
JST資料番号： W5037A  ISSN： 1554-8937  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遊離セリンキナーゼ(SERK)は超好熱性古細菌Thermococcus kodakarensisにおけるL-システイン生合成に関与する。酵素はADPとL-セリン(Ser)をAMPとO-ホスホ-L-セリン(Sep)に変換し,それはL-システインの前駆体である。SERKは遊離セリンをリン酸化する最初の同定酵素であるが,セリン/スレオニン蛋白質キナーゼは良く研究されている。SERKは既知キナーゼと低い配列類似性を示し,その反応機構は既知キナーゼと異なることを示唆した。ここでは,T.kodakarensis(Tk-SerK)からSERKの結晶構造を決定した。全体の構造を2つのドメインに分割した。AMP複合体とADP複合体の2つのドメイン間に大きなクレフトが見られた。三成分複合体(Sep,AMP,およびTk-SerK)において裂は閉じており,三成分基質複合体(Ser,ADP,およびTk-SerK)にも存在する可能性がある。閉鎖はSerのOγ原子に近いE30のカルボキシル基を再配向させる可能性がある。Oγ原子はE30により脱プロトン化され,ADPのβ-リン酸塩を攻撃し,Sepを形成すると考えられる。E30A変異体の活性の実質的減少はこの機構と一致した。著者らの構造はリガンド結合に寄与する残基も明らかにした。細菌からの非特性化蛋白質におけるこれらの残基の保存は,古細菌だけでなく細菌においても遊離Serキナーゼの存在の可能性を高める可能性がある。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *セリン/トレオニンキナーゼ ,  タンパク質 ,  リン酸塩 ,  *生合成 ,  リン酸化 ,  *反応機構 ,  複合体 ,  結晶構造 ,  細菌 ,  キャラクタリゼーション ,  古細菌 ,  ドメイン構造 ,  *キナーゼ ,  微生物 ,  脂肪族アミン ,  チオール ,  脂肪族カルボン酸 ,  含硫アミノ酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： 残基 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (1件)： システイン

タイトルに関連する用語 (4件)： システイン ,  生合成 ,  セリンキナーゼ ,  研究