島村徹平

シマムラテッペイ | Shimamura Teppei

所属機関・部署：
職名：教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (1件)：

研究分野 (2件)：生命、健康、医療情報学 , システムゲノム科学

研究キーワード (8件)：一細胞解析 , マルチオミクス , 遺伝子ネットワーク , オミクス , 次世代シークエンサー , システム生物学 , バイオインフォマティクス , 統計科学

競争的資金等の研究課題 (18件)：

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論文 (130件)：

Chikara Mizukoshi, Yasuhiro Kojima, Satoshi Nomura, Shuto Hayashi, Ko Abe, Teppei Shimamura. DeepKINET: a deep generative model for estimating single-cell RNA splicing and degradation rates. Genome biology. 2024. 25. 1. 229-229
Koichiro Majima, Yasuhiro Kojima, Kodai Minoura, Ko Abe, Haruka Hirose, Teppei Shimamura. LineageVAE: Reconstructing Historical Cell States and Transcriptomes toward Unobserved Progenitors. Bioinformatics (Oxford, England). 2024
Masahiro Hashimoto, Yasuhiro Kojima, Takeharu Sakamoto, Yuki Ozato, Yusuke Nakano, Tadashi Abe, Kiyotaka Hosoda, Hideyuki Saito, Satoshi Higuchi, Yuichi Hisamatsu, et al. Spatial and single-cell colocalisation analysis reveals MDK-mediated immunosuppressive environment with regulatory T cells in colorectal carcinogenesis. EBioMedicine. 2024. 103. 105102-105102
Yasuhiro Kojima, Yuko Arioka, Haruka Hirose, Shuto Hayashi, Yusuke Mizuno, Keiki Nagaharu, Hiroki Okumura, Masato Ishikawa, Kohshi Ohishi, Yutaka Suzuki, et al. Inferring extrinsic factor-dependent single-cell transcriptome dynamics using a deep generative model. 2024
Yasuhiro Kojima, Shinji Mii, Shuto Hayashi, Haruka Hirose, Masato Ishikawa, Masashi Akiyama, Atsushi Enomoto, Teppei Shimamura. Single-cell colocalization analysis using a deep generative model. Cell Systems. 2024. 15. 2. 180-192.e7

MISC (36件)：

村瀬友哉, 武市拓也, 小関準, 宮坂勇輝, 室慶直, 大野民生, 島村徹平, 秋山真志. Nlrp1機能獲得変異による自己炎症性角化症のモデルマウスの作成・病態解析と治療法の開発. 日本皮膚科学会雑誌. 2022. 132. 5. 1375-1375
村瀬友哉, 武市拓也, 小関準, 宮坂勇輝, 室慶直, 大野民生, 島村徹平, 秋山真志. Nlrp1機能獲得変異による自己炎症性角化症のモデルマウスの作成・病態解析と治療法の開発. 日本皮膚科学会雑誌. 2022. 132. 5. 1375-1375
Yasuhide Takeuchi, Annegret Kunitz, Hiromichi Suzuki, Kenichi Yoshida, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Hiroko Tanaka, Teppei Shimamura, Nobuyuki Kakiuchi, Yusuke Shiozawa, et al. Myxofibrosarcoma is characterized by frequent abnormalities in TP53 and increased genetic instability. CANCER RESEARCH. 2019. 79. 13
Yasuhide Takeuchi, Annegret Kunitz, Hiromichi Suzuki, Kenichi Yoshida, Nobuyuki Kakiuchi, Yusuke Shiozawa, Akira Yokoyama, Yoichi Fujii, Tetsuichi Yoshizato, Kosuke Aoki, et al. Comprehensive analysis of genetic alterations and intratumor heterogeneity in myxofibrosarcoma. CANCER RESEARCH. 2018. 78. 13
Yasuhide Takeuchi, Hiromichi Suzuki, Kenichi Yoshida, Yuichi Shiraish, Teppei Shimamura, Tetsuichi Yoshizato, Yusuke Shiozawa, Kenichi Chiba, Hideki Makishima, Satoru Miyano, et al. Comprehensive Analysis of Genetic Alterations and Intratumor Heterogeneity in Myxofibrosarcoma. CANCER SCIENCE. 2018. 109. 716-716

講演・口頭発表等 (4件)：

学歴 (3件)：

学位 (1件)：

経歴 (11件)：

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委員歴 (1件)：

受賞 (3件)：

所属学会 (6件)：

日本メディカルAI学会 , 日本癌学会 , 日本分子生物学会 , 日本バイオインフォマティクス学会 , 日本計算機統計学会 , 日本生化学会

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島村 徹平