- 2022 - 2025 大規模撹乱と野生植物集団の遺伝的多様性:巨大津波を想定した前向き・後ろ向き研究
- 2019 - 2022 稲作の衰退が生物多様性を減少させる:落水後のため池に特有な植物群の現状とその保全
- 2016 - 2019 津波攪乱域に新規に出現した稀少植物群の保全遺伝学的研究-地域固有性の解明と保全
- 2015 - 2018 西日本の渓流沿い植物の系統地理及び集団維持に関する研究
- 2014 - 2017 縄文/弥生移行期における農耕の実態解明に関する研究
- 2012 - 2015 風穴植物の系統地理学-低地に氷河期の足跡を探る
- 2012 - 2015 交雑集団を利用した近縁種間における異なる花冠長への分化過程および維持機構の解析
- 2007 - 2009 ニホンジカ個体数の広域的・効率的管理に向けた施策支援システムの構築
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