研究者
J-GLOBAL ID:201801014530688681   更新日: 2024年10月01日

澄田 智美

スミダ トモミ | Tomomi Sumida
研究分野 (2件): 構造生物化学 ,  応用微生物学
競争的資金等の研究課題 (5件):
  • 2023 - 2026 微生物による鉱物の溶解・沈殿プロセスにおける硫黄酸化代謝の定量的リスト化
  • 2023 - 2025 深海プラスチックの生分解性評価と深海微生物由来分解酵素の探索
  • 2022 - 2025 深海微生物叢情報を利用した新規糖質分解酵素の探索及び機能解析と応用展開
  • 2019 - 2022 光合成色素合成酵素の立体構造からニトロゲナーゼ類似酵素の進化を紐解く
  • 2012 - 2015 新奇スフィンゴ糖脂質分解酵素群を利用した糖脂質代謝機構の解明及び創薬への応用
論文 (16件):
  • Tomomi Sumida, Satoshi Hiraoka, Keiko Usui, Akihiro Ishiwata, Toru Sengoku, Keith A Stubbs, Katsunori Tanaka, Shigeru Deguchi, Shinya Fushinobu, Takuro Nunoura. Genetic and functional diversity of β-N-acetylgalactosamine-targeting glycosidases expanded by deep-sea metagenome analysis. Nature communications. 2024. 15. 1. 3543-3543
  • Yuto Fukuyama, Shigeru Shimamura, Sanae Sakai, Yuta Michimori, Tomomi Sumida, Yoshito Chikaraishi, Haruyuki Atomi, Takuro Nunoura. Development of a rapid and highly accurate method for 13C tracer-based metabolomics and its application on a hydrogenotrophic methanogen. ISME communications. 2024. 4. 1. ycad006
  • Tomomi Sumida, Satoshi Hiraoka, Keiko Usui, Akihiro Ishiwata, Toru Sengoku, Keith A Stubbs, Katsunori Tanaka, Shigeru Deguchi, Shinya Fushinobu, Takuro Nunoura. Genetic and functional diversity of β-N-acetylgalactosamine residue-targeting glycosidases expanded by deep-sea metagenome. bioRxiv. 2023
  • Satoshi Hiraoka, Tomomi Sumida, Miho Hirai, Atsushi Toyoda, Shinsuke Kawagucci, Taichi Yokokawa, Takuro Nunoura. Diverse DNA modification in marine prokaryotic and viral communities. Nucleic acids research. 2022. 50. 3. 1531-1550
  • Tomomi Sumida, Svetlana Dubiley, Brendan Wilcox, Konstantin Severinov, Shunsuke Tagami. Structural Basis of Leader Peptide Recognition in Lasso Peptide Biosynthesis Pathway. ACS chemical biology. 2019. 14. 7. 1619-1627
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MISC (38件):
  • 澄田智美. 深海メタゲノム情報とドメイン検索を利用した新規糖質分解酵素群の探索及び構造機能解析. 第24回 日本蛋白質科学会年会. 2024
  • 深海バイオリソースを統合した生物鉱学カルチャーコレクション構想. 日本農芸化学会 2024年度東京大会. 2024
  • 澄田智美. 深海メタゲノム情報から見出された新規糖質分解酵素群の機能的多様性の解明. 酵素応用シンポジウム(Web). 2024. 25th
  • KOBAYASHI Kanae, MAKABE Akiko, SHIGEMITSU Masahito, HIRAOKA Satoshi, TSUDA Miwako, MIYAZAKI Masayuki, SUMIDA Tomomi, NOMAKI Hidetaka, NUNOURA Takuro, KAWAGUCHI Shinsuke. 分子分析と安定同位体分析を組み合わせて深海堆積物中の微生物の窒素循環を明らかにする. 日本微生物生態学会大会(Web). 2023. 36th
  • FUKUYAMA Yuto, SHIMAMURA Shigeru, SUMIDA Tomomi, CHIBA Yoko, CHIKARAISHI Yoshito, ATOMI Haruyuki, NUNOURA Takuro. CE-MSを用いた13Cトレーサーに基づくメタボロミクスにより明らかになった超好熱性細菌と従属栄養細菌におけるCO2の同化. 日本微生物生態学会大会(Web). 2023. 36th
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書籍 (1件):
  • 微生物資源の整備と利活用の戦略
    エヌ・ティー・エス 2023 ISBN:9784860438586
受賞 (3件):
  • 2024 - 第25回 酵素応用シンポジウム 研究奨励賞
  • 2019 - 日本微生物生態学会 優秀ポスター賞(博士号取得者の部)
  • 2013 - 日本糖質学会年会 日本糖質学会ポスター賞
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