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J-GLOBAL ID：201802210900453160   整理番号：18A1789035

MAPLE 2.3.0:ゲノムとメタゲノムの機能評価を行うために改良されたシステム

MAPLE 2.3.0: an improved system for evaluating the functionomes of genomes and metagenomes

著者 (8件)： ARAI Wataru (JAMSTEC, Yokohama, JPN) ,  TANIGUCHI Takeaki (Mitsubishi Res. Inst., Tokyo, JPN) ,  GOTO Susumu (Res. Organization of Information and Systems, Kashiwa, JPN) ,  MORIYA Yuki (Res. Organization of Information and Systems, Kashiwa, JPN) ,  UEHARA Hideya (Hewlett-Packard Japan, Ltd, Tokyo, JPN) ,  TAKEMOTO Kazuhiro (Kyushu Inst. of Technol., Fukuoka, JPN) ,  OGATA Hiroyuki (Kyoto Univ., Uji, JPN) ,  TAKAMI Hideto (JAMSTEC, Yokohama, JPN)
資料名： Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry  (Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry)
巻： 82  号： 9  ページ： 1515-1517  発行年： 2018年09月 
JST資料番号： G0021A  ISSN： 0916-8451  CODEN： BBBIEJ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： MAPLEはゲノムとメタゲノムにより獲得される潜在的な包括的...

シソーラス用語： *プログラムパッケージ ,...
準シソーラス用語： *GHOSTX ,...

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分類 (3件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  数値計算  (JE02000J)

引用文献 (6件)：

• Takami H, Taniguchi T, Moriya Y, et al Evaluation method for the potential functionome harbored in the genome and metagenome. BMC Genomics. 2012;13:699.
• Takami H, Taniguchi T, Arai W, et al An automated system for evaluation of the potential functionome: MAPLE version 2.1.0. DNA Res. 2016;23:467-475.
• Suzuki S, Kakuta M, Ishida T, et al An improved sequence homology search algorithm using a query suffix array and a database suffix array. PLoS One. 2014;9(8):e103833.
• Moriya Y, Itoh M, Yoshizawa AC, et al KAAS: an automatic genome annotation and pathway reconstruction server. Nucleic Acids Res. 2007;35:W182-W5.
• Venter JC, Remington K, Heidelberg JF, et al Environmental genome shotgun sequencing of the Sargasso Sea. Science. 2004;304:66-74.

タイトルに関連する用語 (4件)： Maple ,  ゲノム ,  メタゲノム ,  機能評価