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J-GLOBAL ID：201802211004990749   整理番号：18A0392733

腸共生細菌Bacteroides cellulosilyticus WH2からのファミリー39グリコシドヒドロラーゼへの構造的洞察【Powered by NICT】

Structural insights into a family 39 glycoside hydrolase from the gut symbiont Bacteroides cellulosilyticus WH2

著者 (16件)： Ali-Ahmad Ahmad (CNRS, Aix Marseille Univ, AFMB, Marseille, France) ,  Ali-Ahmad Ahmad (INRA, USC 1408, AFMB, Marseille, France) ,  Garron Marie-Line (CNRS, Aix Marseille Univ, AFMB, Marseille, France) ,  Garron Marie-Line (INRA, USC 1408, AFMB, Marseille, France) ,  Zamboni Veronique (CNRS, Aix Marseille Univ, AFMB, Marseille, France) ,  Zamboni Veronique (INRA, USC 1408, AFMB, Marseille, France) ,  Lenfant Nicolas (CNRS, Aix Marseille Univ, AFMB, Marseille, France) ,  Lenfant Nicolas (INRA, USC 1408, AFMB, Marseille, France) ,  Nurizzo Didier (European Synchrotron Radiation Facility, 71, Avenue des Martyrs, 38000 Grenoble, France) ,  Henrissat Bernard (CNRS, Aix Marseille Univ, AFMB, Marseille, France) ,  Henrissat Bernard (INRA, USC 1408, AFMB, Marseille, France) ,  Berrin Jean-Guy (INRA, Aix-Marseille University, BBF, Marseille, France) ,  Bourne Yves (CNRS, Aix Marseille Univ, AFMB, Marseille, France) ,  Bourne Yves (INRA, USC 1408, AFMB, Marseille, France) ,  Vincent Florence (CNRS, Aix Marseille Univ, AFMB, Marseille, France) ,  Vincent Florence (INRA, USC 1408, AFMB, Marseille, France)
資料名： Journal of Structural Biology  (Journal of Structural Biology)
巻： 197  号： 3  ページ： 227-235  発行年： 2017年 
JST資料番号： W0838A  ISSN： 1047-8477  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒト腸から細菌は食事および宿主由来のグリカンを分解する炭水化物活性酵素の蓄積を装備している。本研究では,著者らはGH39ファミリー内の新たなサブグループの代表的なヒト腸内細菌Bacteroides cellulosilyticus WH2からメンバー(GH39wh2)の2.5Å分解能結晶構造を提示した。6他のGHと共に,GH39wh2検出,結合と腸管からの特異的炭水化物種を加水分解に関与していることを多糖類利用遺伝子座(PUL)に属する。GH39wh2は触媒残基を含む典型的な(β/α)8-バレル折畳みによって支配され,β-サンドイッチアクセサリードメインによって修飾されたファミリーGH39の他のメンバーと似た構造を共有している。GH39wh2構造は非定型浅い溝よりもむしろ触媒界面を取り囲む表面ループで急激な再配列による深いポケットを明らかにした。これらの構造適応は大きな分枝基質の認識に適していると考えられとGH39メンバーからの小さいキシロースおよび他の典型的な基質に対するGH39wh2の活性の欠如を説明し,GH39ファミリー内の分子多様性を重視した可能性がある。全GH39ファミリーの系統発生解析は,新しいサブグループ,複雑なグリカン鎖に対する新しい基質特異性を与える可能性があることを活性部位領域の広範なリモデリングと一致GH39wh2を割り当てる。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *細菌 ,  結晶構造 ,  多糖類 ,  活性部位 ,  *Bacteroides ,  ヒト ,  系統発生 ,  基質特異性 ,  基質 ,  加水分解 ,  触媒 ,  ペントース ,  アルドース
準シソーラス用語： 分子多様性 ,  腸内細菌 ,  グリカン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Bacteroides ,  エンドグリコシダーゼ ,  グリコシドヒドロラーゼ39 ,  Phylogeny

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (1件)： キシロース

タイトルに関連する用語 (6件)： 腸 ,  共生細菌 ,  Bacteroides ,  ファミリー ,  グリコシドヒドロラーゼ ,  洞察