文献

J-GLOBAL ID：201802216642027533   整理番号：18A0976420

喫煙者およびCOPD患者の末梢肺組織におけるDNAメチル化プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

DNA methylation profiling in peripheral lung tissues of smokers and patients with COPD

著者 (8件)： Sundar Isaac K. (Department of Environmental Medicine, University of Rochester Medical Center, Rochester, USA) ,  Yin Qiangzong (Department of Environmental Medicine, University of Rochester Medical Center, Rochester, USA) ,  Baier Brian S. (Department of Environmental Medicine, University of Rochester Medical Center, Rochester, USA) ,  Yan Li (Department of Biostatistics and Bioinformatics, Roswell Park Cancer Institute, Buffalo, USA) ,  Mazur Witold (Heart and Lung Center, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Helsinki, Finland) ,  Li Dongmei (Department of Clinical & Translational Research, University of Rochester Medical Center, Rochester, USA) ,  Susiarjo Martha (Department of Environmental Medicine, University of Rochester Medical Center, Rochester, USA) ,  Rahman Irfan (Department of Environmental Medicine, University of Rochester Medical Center, Rochester, USA)
資料名： Clinical Epigenetics (Web)  (Clinical Epigenetics (Web))
巻： 9  号： 1  ページ： 38  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7316A  ISSN： 1868-7083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:遺伝学的変化はタバコ喫煙により影響されることが示されている。タバコ煙(CS)仲介DNAメチル化は,慢性閉塞性肺疾患(COPD)患者の肺において,いくつかの細胞および病態生理学的過程,急性増悪および共存症に潜在的に影響する可能性がある。喫煙者とCOPD患者のゲノム全体の肺DNAメチル化プロフィールが非喫煙者と有意に異なるかどうかを調べた。8人の生涯非喫煙者,8人の現在の喫煙者,8人のCOPD患者を含む患者の実質肺組織からDNAを分離し,Illumina Infinium HumanMylation450 BeadChipを用いて試料を分析した。【結果】著者らのデータは,差別的にメチル化された遺伝子が,COPD患者におけるトップ標準経路(例えば,Gβγシグナル伝達,癌の機構およびニューロンにおけるnNOSシグナル伝達),疾患および疾患(組織損傷および異常,癌および呼吸疾患),および分子および細胞機能(細胞死および生存,細胞機能および維持)に関連することを明らかにした。全ゲノムDNAメチル化分析により,NOS1AP,TNFAIP2,BID,gabrb1,ATXN7,およびTHOC7のような示唆遺伝子を同定し,さらにピロシークエンシングにより確認したCOPD肺組織におけるDNAメチル化変化を同定した。ピロシーケンス検証により,喫煙者およびCOPD患者において非喫煙者と比較して高メチル化が確認された。しかし,全ゲノム解析で観察された変化にもかかわらず,喫煙者およびCOPD群において,TNFAIP2,ATXN7およびTHOC7遺伝子に対するDNAメチル化の有意差は検出されなかった。結論:著者らの研究は,NOS1AP,BIDおよびgabrb1のような示唆遺伝子におけるDNAメチル化が喫煙者およびCOPD患者における後成的特徴として使用される可能性があることを示唆する。本研究で同定された選択的遺伝子のトランスクリプトームとDNAメチル化状態を相関させ,COPDの進行とその悪化における役割と関与を明らかにするために,将来の研究が必要である。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ゲノム ,  *慢性閉塞性肺疾患 ,  たばこ ,  トランスクリプトーム ,  *メチル化 ,  ニューロン ,  *患者 ,  *喫煙 ,  *DNA【核酸】 ,  細胞死
準シソーラス用語： 細胞機能 ,  非喫煙者 ,  病態 ,  *DNAメチル化 ,  *喫煙者 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： DNAメチル化 ,  肺 ,  エピジェネティクス ,  COPD ,  喫煙者 ,  ピロシークエンシング

分類 (1件)： 呼吸器の疾患  (GI03000Z)

引用文献 (61件)：

• Toxicol Appl Pharmacol; Current concepts on oxidative/carbonyl stress, inflammation and epigenetics in pathogenesis of chronic obstructive pulmonary disease; H Yao, I Rahman; 254; 2011; 72-85; 10.1016/j.taap.2009.10.022; CR1;
• Curr Opin Pulm Med; Lung cancer and its association with chronic obstructive pulmonary disease: update on nexus of epigenetics; IK Sundar, N Mullapudi, H Yao, SD Spivack, I Rahman; 17; 2011; 279-285; 10.1097/MCP.0b013e3283477533; CR2;
• Antioxid Redox Signal; Oxidative stress and chromatin remodeling in chronic obstructive pulmonary disease and smoking-related diseases; IK Sundar, H Yao, I Rahman; 18; 2013; 1956-1971; 10.1089/ars.2012.4863; CR3;
• Morrow JD, Cho MH, Hersh CP, Pinto-Plata V, Celli B, Marchetti N, Criner G, Bueno R, Washko G, Glass K, et al. DNA methylation profiling in human lung tissue identifies genes associated with COPD. Epigenetics. 2016;11:730-39.
• Chest; Cigarette smoke-induced hypermethylation of the GCLC gene is associated with COPD; L Cheng, J Liu, B Li, S Liu, X Li, H Tu; 149; 2016; 474-482; 10.1378/chest.14-2309; CR5;

タイトルに関連する用語 (6件)： 喫煙者 ,  COPD ,  患者 ,  肺組織 ,  DNAメチル化 ,  プロファイリング