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J-GLOBAL ID：201802216819662459   整理番号：18A0974084

パキスタン人家族における常染色体劣性骨減少症と関連したV-ATPアーゼA3サブユニットにおける新規p.p208pfsx1変異の同定とin silico特性化【JST・京大機械翻訳】

Identification and in silico characterization of a novel p.P208PfsX1 mutation in V-ATPase a3 subunit associated with autosomal recessive osteopetrosis in a Pakistani family

著者 (11件)： Ajmal Muhammad (Institute of Biomedical and Genetic Engineering, Islamabad, Pakistan) ,  Mir Asif (Department of Biotechnology, International Islamic university, Islamabad, Pakistan) ,  Wahid Sughra (KRL General Hospital, Islamabad, Pakistan) ,  Khor Chiea Chuen (Human Genetics, Genome Institute of Singapore, A*STAR, Singapore, Singapore) ,  Khor Chiea Chuen (Department of Biochemistry, Yong Loo Lin School of Medicine, National University of Singapore, Singapore, Singapore) ,  Foo Jia Nee (Human Genetics, Genome Institute of Singapore, A*STAR, Singapore, Singapore) ,  Foo Jia Nee (Lee Kong Chian School of Medicine, Nanyang Technological University, Singapore, Singapore) ,  Siddiqi Saima (Institute of Biomedical and Genetic Engineering, Islamabad, Pakistan) ,  Kauser Mehran (Institute of Biomedical and Genetic Engineering, Islamabad, Pakistan) ,  Malik Salman Akbar (Department of Biochemistry, Quaid-i-Azam University, Islamabad, Pakistan) ,  Nasir Muhammad (Institute of Biomedical and Genetic Engineering, Islamabad, Pakistan)
資料名： BMC Medical Genetics (Web)  (BMC Medical Genetics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 148  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7307A  ISSN： 1471-2350  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 骨ope症は,欠損した破骨細胞性骨吸収により引き起こされる骨密度の増加として主に記述されるまれな遺伝性骨疾患である。今日まで,11個の遺伝子の遺伝的変異体は,異なるタイプの骨形成と関連することが報告されている。しかし,疾患の致死的な形態である悪性乳児骨形成症は,TCIRG1遺伝子における突然変異(s)によって引き起こされる大部分(50%)である。本研究において,著者らは,臨床的および遺伝的に,乳児の骨ope症の基礎となる分子基盤を解明するために,臨床的および遺伝学的にコンサanguのパキスタンの家族を調査した。5つのファミリーメンバーからのDNAサンプルをSNPアレイに基づく全ゲノムホモ接合性マッピングにかけた。データを分析し,潜在的に病原性突然変異を,家族における3つの表現型健康な個人と同様に2つの影響を受けたSanger配列決定によって同定した。同定された病原性変異の有意性と蛋白質構造と機能に及ぼすその影響を様々な生物情報学ツールを用いて研究した。5つのファミリーメンバーからのDNAサンプルを,TCIRG1遺伝子を持つchr11上の4Mb領域を同定したゲノムワイドSNPアレイ遺伝子タイピングとホモ接合性マッピングを行った。Sangerシークエンシングは,TCIRG1遺伝子のエキソン6における新規ホモ接合欠失c.624delCがV-ATPアーゼ複合体のa3サブユニットをコードすることを明らかにした。同定された欠失は,208aaの短縮蛋白質を産生するフレームシフトをもたらした。V-ATPアーゼ複合体のa3サブユニットの早期停止のin silico分析は,蛋白質構造に有害な影響を明らかにし,乳児の骨形成を引き起こすV-ATPアーゼ機能の障害または完全な消失を予測した。V-ATPアーゼ複合体のa3サブユニットは骨吸収過程において重要な役割を果たすので,構造的に異常なa3サブユニットは骨吸収過程に悪影響を及ぼし,パキスタンファミリーにおける乳児骨形成をもたらす可能性がある。したがって,本研究は骨形成の遺伝子型スペクトルを拡大するだけでなく,骨吸収過程におけるV-ATPアーゼa3サブユニットの役割の理解を改善する。さらに,著者らの知見は遺伝的カウンセリングに役立ち,疾患の病因と潜在的な標的治療へのさらなる洞察を提供するはずである。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： DNA【核酸】 ,  遺伝子型 ,  遺伝 ,  *サブユニット ,  複合体 ,  骨吸収 ,  骨形成 ,  表現型 ,  ヒト ,  タンパク質 ,  乳児 ,  突然変異 ,  病因 ,  ゲノム ,  *ATPアーゼ

著者キーワード (5件)： 小児悪性骨壊死症 ,  ヒトTCIRG1遺伝子 ,  V-ATPアーゼ ,  V0ドメイン ,  A3サブユニット

分類 (2件)： 先天性疾患・奇形一般  (GD03010V) ,  神経系の疾患  (GN03000O)

引用文献 (29件)：

• Paediatr Child Health; When bone becomes marble: head and neck manifestations of osteopetrosis; A Hamdan, MM Nabulsi, FT Farhat, RK Haidar, NS Fuleihan; 11; 2006; 37-40; 10.1093/pch/11.1.37; citation_id=CR1
• Nat Rev Endocrinol; Osteopetrosis: genetics, treatment and new insights into osteoclast function; C Sobacchi, A Schulz, FP Coxon, A Villa, MH Helfrich; 9; 2013; 522-536; 10.1038/nrendo.2013.137; citation_id=CR2
• Annu Rev Pathol; Disorders of bone remodeling; X Feng, JM McDonald; 6; 2011; 121-145; 10.1146/annurev-pathol-011110-130203; citation_id=CR3
• J Can Dent Assoc; Marble bone disease: a review of osteopetrosis and its oral health implications for dentists; DK Lam, GK Sandor, HI Holmes, RP Carmichael, CM Clokie; 73; 2007; 839-843; citation_id=CR4
• Gene; A novel mutation and a known mutation in the CLCN7 gene associated with relatively stable infantile malignant osteopetrosis in a Chinese patient; B Zeng, R Li, Y Hu, B Hu, Q Zhao, H Liu, P Yuan, Y Wang; 576; 2016; 176-181; 10.1016/j.gene.2015.10.021; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (10件)： パキスタン ,  家族 ,  常染色体 ,  劣性 ,  骨減少症 ,  V-ATPアーゼ ,  サブユニット ,  変異 ,  同定 ,  特性化