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J-GLOBAL ID：201802217886121068   整理番号：18A0787606

食品関連ミクロビオーム研究に適用した次世代シークエンシング技術の応用に関するレビュー【JST・京大機械翻訳】

A Review on the Applications of Next Generation Sequencing Technologies as Applied to Food-Related Microbiome Studies

著者 (5件)： Cao Yu (UCD-Centre for Food Safety, Science Centre South, University College Dublin) ,  Fanning Seamus (UCD-Centre for Food Safety, Science Centre South, University College Dublin) ,  Proos Sinead (Food for Health Ireland, Science Centre South, University College Dublin) ,  Jordan Kieran (Teagasc, Food Research Centre) ,  Srikumar Shabarinath (UCD-Centre for Food Safety, Science Centre South, University College Dublin)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 1829  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 次世代シークエンシング(NGS)技術の開発は,研究者がより広く深い視点から微生物の世界を研究し理解することを可能にした。DNA配列決定技術における現代の進歩は,細菌ゲノムのより微細な特性化を可能にしただけでなく,そのゲノム本質における複雑な微生物のより深い分類学的同定も環境に生息する微生物の複合遺伝物質である。今日まで,16S rDNA塩基配列決定,メタゲノムおよびメタトランスクリプトは,食品関連微生物の分類学的同定および特性化に使用される3つの塩基配列決定戦略である。これらの配列決定戦略は,DNAとRNA配列同定のために異なるNGSプラットフォームを使用した。Tradddi,16S rDNA配列決定は,食品関連微生物の分類学的組成を理解する上で重要な役割を果たしている。最近,メタゲノム手法は,種レベル/株レベルの特性化を提供することにより,ミクロビオームの理解を改善した。さらに,メタトラン法は,単一の微生物群内の異なる微生物群集間の複雑な相互作用の機能的特性化に寄与した。多くの研究は,発酵食品の微生物の研究におけるNGS技術の利用を強調した。しかし,非発酵食品の微生物の研究におけるNGS技術の利用は限られている。本レビューは,技術が第1,第3世代から進歩し,NGSが非発酵食品に特別な焦点を持つ食品関連微生物のより深い理解を提供することを強調するので,DNA配列決定化学の進歩の簡単な概観を提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 発酵食品 ,  ミクロフローラ ,  ヌクレオチド配列 ,  キャラクタリゼーション ,  DNA【核酸】 ,  ゲノム ,  *食品 ,  RNA【核酸】 ,  微生物
準シソーラス用語： リボソームDNA ,  メタゲノム ,  分類学 ,  DNA配列 ,  *次世代シークエンシング ,  *常在菌叢ゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 次世代シークエンシング ,  食品ミクロビオーム ,  16S rDNA ,  メタゲノミクス ,  メタトランスクリプトミクス

分類 (2件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (6件)： 食品 ,  ミクロビオーム ,  研究 ,  次世代シークエンシング ,  応用 ,  レビュー