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J-GLOBAL ID：201802218242273504   整理番号：18A0818399

ARDSと関連した分泌性ホスホリパーゼA2-IIAにおけるR123H変異体によって引き起こされる分子効果のin silico研究【JST・京大機械翻訳】

In silico investigation of the molecular effects caused by R123H variant in secretory phospholipase A2-IIA associated with ARDS

著者 (10件)： Righino Benedetta (Institute of Biochemistry and Clinical Biochemistry, Catholic University of the Sacred Heart, L.go F. Vito 1, 00168 Rome, Italy) ,  Minucci Angelo (Institute of Biochemistry and Clinical Biochemistry, Catholic University of the Sacred Heart, L.go F. Vito 1, 00168 Rome, Italy) ,  Minucci Angelo (Department of Laboratory Medicine, ”Policlinico Gemelli” Foundation, L.go A. Gemelli 1, 00168 Rome, Italy) ,  Pirolli Davide (Institute of Chemistry of Molecular Recognition - CNR, c/o Catholic University of the Sacred Heart, L.go F. Vito 1, 00168 Rome, Italy) ,  Capoluongo Ettore (Institute of Biochemistry and Clinical Biochemistry, Catholic University of the Sacred Heart, L.go F. Vito 1, 00168 Rome, Italy) ,  Capoluongo Ettore (Department of Laboratory Medicine, ”Policlinico Gemelli” Foundation, L.go A. Gemelli 1, 00168 Rome, Italy) ,  Conti Giorgio (PICU, Department of Anesthesiology and Critical Care, Catholic University of the Sacred Heart, L.go F. Vito 1, 00168 Rome, Italy) ,  De Luca Daniele (PICU, Department of Anesthesiology and Critical Care, Catholic University of the Sacred Heart, L.go F. Vito 1, 00168 Rome, Italy) ,  De Luca Daniele (APHP, South Paris University Hospitals, Medical Center ”A. Beclere”, Paris, France) ,  De Rosa Maria Cristina (Institute of Chemistry of Molecular Recognition - CNR, c/o Catholic University of the Sacred Heart, L.go F. Vito 1, 00168 Rome, Italy)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 81  ページ： 68-76  発行年： 2018年 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ホスホリパーゼA2-IIAはグリセロリン脂質のsn-2エステルの加水分解を触媒する。全コード領域とエクソン/イントロン境界配列決定により,急性呼吸窮迫症候群(ARDS)により影響を受けた2人の乳児において,Par2g2a遺伝子における稀なc.428G>A(p.Arg143His)変異体が見出された。分泌PLA2-IIA(sPLA2-IIA)における稀なR123H変異の可能な分子効果への洞察を得るために,主成分分析(PCA)及び連続体静電計算を用いた分子動力学(MD)を野生型蛋白質の結晶構造及びR123H変異体の生成モデル構造について行った。MDトラジェクトリーの解析は,蛋白質の全体的安定性がこの変異により影響されないが,Tyr51とAsp91の間の触媒的に重要なH結合と変異部位に近い領域における主な静電相互作用が変化することを示す。PCA結果は,R123H置換が酵素の内部分子運動を変化させ,集団運動が増加することを示した。静電表面電位研究は,変異後にアニオン性リン脂質膜とアニオン性蛋白質への界面結合が変化することを示唆する。静電相互作用の強化は活性部位領域に伝播し,基質認識と酵素活性に影響する可能性がある。著者らの知見は,sPLA2の構造と機能に及ぼす突然変異の影響に関するさらなる研究と進歩の基礎を提供する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： グリセロリン脂質 ,  酵素活性度 ,  加水分解 ,  タンパク質 ,  主成分分析 ,  結晶構造 ,  水素結合 ,  突然変異 ,  活性部位 ,  静電相互作用 ,  計算機シミュレーション ,  *変異 ,  表面電位 ,  分子動力学 ,  *ホスホリパーゼA2
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 分子動力学シミュレーション ,  SPLA2 ,  PLA2G2A遺伝子 ,  分子モデリング ,  静電ポテンシャル

分類 (4件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W)

タイトルに関連する用語 (5件)： ARDS ,  分泌性ホスホリパーゼA2 ,  変異体 ,  分子 ,  研究