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J-GLOBAL ID：201802225705435810   整理番号：18A1381823

新規フルオロキノロン分子の分子モデリング研究【JST・京大機械翻訳】

Molecular Modeling Studies of Novel Fluoroquinolone Molecules

著者 (4件)： Allaka Tejeswara Rao (Centre for Chemical Sciences and Technology, Institute of Science & Technology, Jawaharlal Nehru Technological University Hyderabad, Kukatpally, Hyderabad, Telangana 500 085, India) ,  Katari Naresh Kumar (Department of Chemistry, GITAM School of Technology, GITAM University, HTP Campus, Rudraram, Medak, Telangana 502 329, India) ,  Veeramreddy Venkataramireddy (Centre for Chemical Sciences and Technology, Institute of Science & Technology, Jawaharlal Nehru Technological University Hyderabad, Kukatpally, Hyderabad, Telangana 500 085, India) ,  Anireddy Jaya Shree (Centre for Chemical Sciences and Technology, Institute of Science & Technology, Jawaharlal Nehru Technological University Hyderabad, Kukatpally, Hyderabad, Telangana 500 085, India)
資料名： Current Drug Discovery Technologies  (Current Drug Discovery Technologies)
巻： 15  号： 2  ページ： 109-122  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3582A  ISSN： 1570-1638  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 不明 (ARE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:フルオロキノロンは,それらの広いスペクトル薬理活性のために,かなりの科学的および臨床的関心の中心であった。ペフロキサシンはノルフロキサシンの類似体であり,シプロフロキサシンに類似したフルオロキノロン抗生物質の第3世代である。ペフロキサシンは,呼吸器,耳,鼻および咽頭(ENT)感染症,皮膚感染症および尿路感染症のような様々な細菌感染症を治療するために使用される。フルオロキノロン類の構造活性相関(SAR)研究のため,薬物化学者を引き付けるファーマコフォア単位としてのヒドラゾンは,特にC-3位における機能性である。その結果,蛋白質標的に特異的に潜在的リガンドの認識と開発が薬物発見過程における主要な目標を形成する。利用可能な異なる理論的アプローチの中で,GoldとGideは応用蛋白質リガンド研究を見出す分子ドッキング法である。本研究では,黄色ぶどう球菌のDNAギラーゼを標的蛋白質として用いて,それらの可能な相互作用を理解した。【方法】DNAギラーゼ(トポイソメラーゼII)の結晶構造を蛋白質データバンク(PDB ID:2XCS,3FOE)からダウンロードし,分子ドッキング研究をGold3.2のようなドッキングプログラムを用いて行った。融点装置内の開放毛細管において融点を補正し,測定した。シリカゲル-G上でTLCを行い,ヨウ素/KMnO4染色またはUV光を用いてスポッティングを行った。すべての化合物を合成するために使用される一般的な手順の代表である。結果:DNAギラーゼ2XCSの2.1Å結晶構造を持つ標題化合物のドッキング実験,Gold3.2とGide5.0を用いた3FOEを行い,抗菌活性に寄与する蛋白質との新規リガンドの結合相互作用を理解した。一般的に化合物は,H-結合相互作用及び蛋白質-配位子複合体を安定化するπ-π相互作用のような良好な結合相互作用を示し,両プロトコルにおいて良好な適合性スコアをもたらした。結論:要約すると,新しい一連の新しいペフロキサシンヒドラゾン5a-5nを,Gide5.0とGold3.2分子ドッキングプロトコル[PDB IDS:2XCS,3FOE]による黄色ぶどう球菌DNAギラーゼ蛋白質との相互作用について研究した。試験した分子の中で,化合物5gは-7.73の良好なGideスコア値と-66.16のeモデル値を持つGideエネルギー-51.24を示した。5g,5a,8h,5mおよび5bのniceドッキングスコアは,これらの化合物がDNAギラーゼ酵素の活性部位残基に良く適合することを明らかにした。ドッキング研究から,化合物5f,5l,5h,5d,及び5nの結合様式の可能性を調べ,それらがDNAギラーゼ酵素の黄色ぶどう球菌の活性部位と強く相互作用することを示した。スクリーニング結果から,電子放出基で置換された芳香環を有する化合物は強力なドッキングスコアを示し,参照化合物CPF及びCA4よりも良好な適合性を示すことが分かった。分子モデリングと生物学的活性の効率的な組み合わせは,ペフロキサシン誘導体のさらなる開発と最適化を助けるQSARガイドラインへの洞察を提供した。Copyright 2018 Bentham Science Publishers All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヒドラゾン ,  *ニューキノロン系抗細菌薬 ,  結晶構造 ,  生物活性 ,  相互作用 ,  タンパク質 ,  スクリーニング ,  抗生物質 ,  抗細菌作用 ,  最適化 ,  ドッキング ,  複合体 ,  黄色ぶどう球菌 ,  活性部位
準シソーラス用語： DNAギラーゼ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ペフロキサシン・ヒドラゾン ,  分子ドッキング ,  schrodingerソフトウェア ,  DNAギラーゼ ,  フルオロキノロン ,  蛋白質

分類 (1件)： 抗細菌薬の基礎研究  (GW17020S)

タイトルに関連する用語 (4件)： フルオロキノロン ,  分子 ,  分子モデリング ,  研究