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J-GLOBAL ID：201802226143288990   整理番号：18A1514188

ビタミンD受容体(VDR)に関する原子ベースおよび薬理作用団に基づく3D-QSAR研究【JST・京大機械翻訳】

Atom-based and Pharmacophore-based 3D - QSAR Studies on Vitamin D Receptor (VDR)

著者 (3件)： Nagamani Selvaraman (Deparment of Bioinformatics, Alagappa University, Karaikudi 630 004, Tamil Nadu, India) ,  Kesavan Chandrasekhar (Musculoskeletal Disease Center, JLP VA Medical Center, Loma Linda, CA 92357, United States) ,  Muthusamy Karthikeyan (Deparment of Bioinformatics, Alagappa University, Karaikudi 630 004, Tamil Nadu, India)
資料名： Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening  (Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening)
巻： 21  号： 5  ページ： 329-343  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3560A  ISSN： 1386-2073  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 不明 (ARE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 目的と目的:ビタミンD3(1,25(OH)2D3)は生物学的に活性な代謝産物であり,ヒト系において広範な調節機能を果たす。現在,いくつかのビタミンD類似体が合成され,VDR(ビタミンD受容体)に対して試験されている。静電ポテンシャル法は構造に基づく薬物発見に大きく影響する。本研究では,ab inito(DFT,HF,LMP2)および半経験的(RM1,AM1,PM3,MNDO,MNDO/d)電荷を,誘導Fit Docking(IFD)を用いたドッキング姿勢の予測およびVDRに対する結合自由エネルギー計算に基づいて調べた。材料と方法:最初に,38のビタミンD類似体にab initioと半経験的電荷を適用した。さらに,荷電類似体はVDR活性部位でドッキングした。ビタミンD類似体のドッキング立体配座から構造に基づく3D-QSARを生成した。一方,薬理作用に基づく3D-QSARを実施した。【結果】結果は,AM1が著者らの研究のための良い電荷モデルであり,AM1電荷ベースのQSARがより正確な配位子を生成することを示している。さらに,ビタミンD類似体の側鎖のヒドロキシル基はVDR拮抗活性に重要な役割を果たしている。結論:全体として,リガンドの電荷に基づく最適化が薬理作用団に基づくQSARモデルよりも実行されることを見出した。Copyright 2018 Bentham Science Publishers All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヒドロキシ基 ,  立体配座 ,  *定量的構造活性相関 ,  *三次元 ,  類似物質 ,  *薬理作用 ,  ヒト ,  ドッキング ,  活性部位 ,  電荷 ,  *ビタミンD受容体 ,  側鎖 ,  *ビタミンD
準シソーラス用語： 静電ポテンシャル ,  *3D-QSAR , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ビタミンD受容体 ,  3D-QSAR ,  経験的および半経験的計算 ,  AM1 ,  誘導適合ドッキング ,  ビタミンD類似体

分類 (3件)： ビタミンD  (EB07050H) ,  細胞膜の受容体  (EF04030C) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (5件)： ビタミンD受容体 ,  原子 ,  薬理作用団 ,  3D-QSAR ,  研究