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J-GLOBAL ID：201802227610711083   整理番号：18A0965717

ホルスタイン牛における生産および繁殖形質に対する添加物,優性および刷り込み効果の解剖【JST・京大機械翻訳】

Dissection of additive, dominance, and imprinting effects for production and reproduction traits in Holstein cattle

著者 (6件)： Jiang Jicai (Department of Animal and Avian Sciences, University of Maryland, College Park, USA) ,  Shen Botong (Department of Animal and Avian Sciences, University of Maryland, College Park, USA) ,  O’Connell Jeffrey R. (University of Maryland Baltimore, Baltimore, USA) ,  VanRaden Paul M. (Animal Genomics and Improvement Laboratory, USDA, Beltsville, USA) ,  Cole John B. (Animal Genomics and Improvement Laboratory, USDA, Beltsville, USA) ,  Ma Li (Department of Animal and Avian Sciences, University of Maryland, College Park, USA)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 425  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】ゲノム全体の関連とゲノム選択研究は主に相加作用に焦点を合わせているが,優性と刷込効果は哺乳類の生物学と発達において重要な役割を果たしている。これらの非相加的遺伝的影響が表現型変異に寄与する程度と非相加的方法で作用するQTLが遺伝的関連研究において検出されるかどうかは議論の余地がある。【結果】経験的にこれらの質問に答えるために,著者らは,8つの生産と生殖形質のために遺伝子型化された両親と表現型の記録を持つ42,701の遺伝子型ホルスタイン乳牛から成る大規模なウシのデータセットを分析した。SNP遺伝子型を家系において相補し,対立遺伝子の親の起源を決定し,3成分GREMLを適用して,相加的,優性,および刷込効果に対する分散分解を得た。結果は,生殖形質に対してではなく,優性から生産形質への有意な非ゼロ寄与を示した。インプリンティング効果は,生産と生殖形質の両方に有意に寄与した。興味あることに,インプリンティング効果は生産形質より生殖形質により寄与した。GWASと衝突に基づく微細マッピング分析を用いて,マウスにおける乳生産に関連する候補遺伝子であるRUNX2近くの泌乳量による優性関連シグナルを同定し,検証した。しかし,予測モデルに非添加効果を加えると,分析した8つの形質に対する予測精度の増加はほとんど観察されなかった。結論:これらの結果は,非添加効果がウシの複雑な形質の全遺伝的変異に対する無視できない量(生殖形質に対して)に寄与し,非添加効果を持つQTLの検出が大規模データセットを用いたGWASにおいて可能であることを示唆した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生殖 ,  ゲノム ,  遺伝的影響 ,  *優性 ,  対立遺伝子 ,  遺伝子型 ,  ゲノムワイド関連解析 ,  *ホルスタイン ,  添加物効果 ,  泌乳量 ,  刷込 ,  乳牛 ,  表現型
準シソーラス用語： 遺伝的変異 ,  生産形質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 分散分解 ,  添加剤 ,  優位性 ,  インプリンティング ,  ウシ ,  酪農の特徴 ,  QTL

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (37件)：

• Trends Genet; Genomic imprinting in mammalian development: a parental tug-of-war; T Moore, D Haig; 7; 2; 1991; 45-49; 10.1016/0168-9525(91)90230-N; CR1;
• PLoS Genet; Data and theory point to mainly additive genetic variance for complex traits; WG Hill, ME Goddard, PM Visscher; 4; 2; 2008; e1000008; 10.1371/journal.pgen.1000008; CR2;
• Nature; Finding the missing heritability of complex diseases; TA Manolio, FS Collins, NJ Cox, DB Goldstein, LA Hindorff, DJ Hunter; 461; 7265; 2009; 747-53; 10.1038/nature08494; CR3;
• Nat rev Genet; Epistasis: too often neglected in complex trait studies?; Ö Carlborg, CS Haley; 5; 8; 2004; 618-625; 10.1038/nrg1407; CR4;
• PLoS One; Estimating additive and non-additive genetic variances and predicting genetic merits using genome-wide dense single nucleotide polymorphism markers; G Su, T Ostersen, M Henryon, MS Lund; 7; 9; 2012; e45293; 10.1371/journal.pone.0045293; CR5;

タイトルに関連する用語 (5件)： ホルスタイン牛 ,  繁殖形質 ,  添加物 ,  刷り込み ,  解剖