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J-GLOBAL ID：201802229689934881   整理番号：18A0965741

大規模リガンドスクリーニングのための高密度組換えペプチドチップの集合と使用は合成ペプチドライブラリーに対する実用的代替物である【JST・京大機械翻訳】

Assembly and use of high-density recombinant peptide chips for large-scale ligand screening is a practical alternative to synthetic peptide libraries

著者 (7件)： Hundsberger Harald (Department of Medical and Pharmaceutical Biotechnology, University of Applied Sciences, Krems, Austria) ,  OEnder Kamil (Research Program for Rational Drug Design in Dermatology and Rheumatology, Department of Dermatology, Paracelsus Medical University of Salzburg, Salzburg, Austria) ,  OEnder Kamil (ProComCure Biotech, Anif, Austria) ,  Schuller-Gotzburg Peter (Research Program in Prosthetics, Biomechanics and Biomaterials, Paracelsus Private Medical University, Salzburg, Austria) ,  Virok Dezso P. (Department of Medicinal Microbiology and Immunobiology, University of Szeged, Szeged, Hungary) ,  Herzog Julia (Research Program for Rational Drug Design in Dermatology and Rheumatology, Department of Dermatology, Paracelsus Medical University of Salzburg, Salzburg, Austria) ,  Rid Raphaela (Research Program for Rational Drug Design in Dermatology and Rheumatology, Department of Dermatology, Paracelsus Medical University of Salzburg, Salzburg, Austria)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 450  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】組換えペプチドチップは,最先端のin situ(化学オンチップ)合成,粒子ベースの印刷,または前製造されたペプチドスポッティングに対する多能な補完を構成することができた。制限されたペプチドの長さ,低い多様性および低いアレイ密度から高いコストまでの通常の実装をまだ妨げているボトルネックが克服される可能性がある。【方法】総合的性能を評価するために,著者らは,包括的で高度に多様な(>107の単一クローン)短いランダムペプチドライブラリから,標準96穴マイクロタイタープレートの領域上に38400個の個々のペプチドスポットから成る組換えチップを組み立てた。【結果】Streptアビジンに対する全部で476,160クローンのスクリーニングは,VSHPQAPFを含む特徴的なHPQモチーフとサイクリックCSGSYGSCペプチドの2つの別々の新しいバインダーを明らかにした。相互作用は蛍光偏光と生物学的干渉測定により技術的に確認され,ペプチド融合模範試験蛋白質の検出により評価された新規検出タグとしてのそれらの潜在的適合性を確認した。【結論】著者らのデータから,提示した技術的パイプラインは,新しいヒットを確実に同定することができ,それに続くリガンド設計プラスエンジニアリングのための第一世代バインダーまたはテンプレートとして有用であると結論した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 適応性 ,  干渉測定 ,  *ペプチド ,  相互作用 ,  粘結剤 ,  クローン ,  タンパク質 ,  アビジン ,  親和性 ,  *ペプチドライブラリー
準シソーラス用語： 蛍光偏光 ,  マイクロタイタープレート ,  オンチップ ,  *合成ペプチド ,  *高密度 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： ペプチドライブラリー ,  組換えクローニング ,  組換えペプチドアレイ ,  蛋白質チップ ,  ペプチドスクリーニング ,  蛋白質タグ ,  配位子設計 ,  高親和性 ,  標的結合 ,  多様性

分類 (2件)： 生物学的機能  (EB03040U) ,  生化学的分析法  (EA03030G)

引用文献 (41件)：

• J Biomed Sci; Advancement and applications of peptide phage display technology in biomedical science; CH Wu; 23; 2016; 8; 10.1186/s12929-016-0223-x; CR1;
• Front Immunol; Development of Next-Generation Peptide Binders Using In vitro Display Technologies and Their Potential Applications; A Wada; 4; 2013; 224; 10.3389/fimmu.2013.00224; CR2;
• Nucleic Acids Res; Protein-peptide interactions analyzed with the yeast two-hybrid system; M Yang, Z Wu, S Fields; 23; 7; 1995; 1152-1156; 10.1093/nar/23.7.1152; CR3;
• Letters in Drug Design and Discovery; “Renaissance” of the Yeast Two-Hybrid System - Enhanced for Automation and High-Throughput to Support Proteome-Wide Research; R Rid; 7; 10; 2010; 765-789; 10.2174/1570180811007010765; CR4;
• Proteomics; High-throughput analysis of peptide-binding modules; BA Liu, BW Engelmann, PD Nash; 12; 10; 2012; 1527-1546; 10.1002/pmic.201100599; CR5;

タイトルに関連する用語 (10件)： 大規模 ,  リガンド ,  スクリーニング ,  高密度 ,  組換え ,  ペプチド ,  集合 ,  合成ペプチド ,  ライブラリー ,  代替物